二、操作方法
（一）操作前的各項檢查
1．正常開機以后，檢查沖洗用水裝置是否正常、各項分析試劑是否充足、各種清洗劑是否足夠，以及樣品針、試劑針和攪拌棒是否清潔。
2．確認要進行校準的項目，確認要做的質控批號及項目，以及校準品、質控品是否足夠。
3．進行光度計自檢來確認光路與檢測系統是否處于正常工作狀態。
（二）校準
分析儀在樣品分析之前都要對該分析項目進行校準（也稱定標），得出一個該項目的校準系數（K）。校準前首先必須在反應程序里設定有關校準的參數，如校準液的代碼、位置及濃度值等。執行校準程序，檢測得到該校準品的吸光度值，再根據校準濃度計算校準系數（K=校準品濃度/校準品吸光度）。
1．校準方式 有單點校準、兩點校準和多點校準，大多數檢測項目的校準曲線呈直線且通過原點，用單個濃度的校準液即可，若校準曲線呈直線但不通過原點，則需用兩個濃度的校準液做兩點校準；當校準曲線不呈直線而為真正的曲線時，應做多點校準，并按其線形選擇不同的曲線方程進行擬和，如雙曲線、拋物線、冪函數、指數函數、對數函數等方程等，多數生化分析儀已設置有數種曲線方程可將多點校準的結果自動進行數據處理，得到曲線擬和方程，樣品的檢測吸光度便可通過此方程計算出結果。
2．對校準的要求
（1）選擇合適（配套）的校準品，包括校準品數目、類型和濃度。
（2）如有可能校準品應溯源到參考方法或參考物質。
（3）確定校準的頻度。根據檢測項目方法和試劑的穩定性不同而確定不同的校準頻度，如每日校準、每周校準、每月校準、每兩月校準等，至少每六個月進行一次校準。
（4）如有下列情況發生時，必須進行校準：①改變試劑的種類，或者批號更換了。如果實驗室能說明改變試劑批號并不影響結果的范圍，則可以不進行校準。②儀器或者檢驗系統進行一次大的預防性維護或者更換了重要部件，這些都有可能影響檢驗性能。③質控反映出異常的趨勢或偏移，或者超出了實驗室規定的接受限，采取一般性糾正措施后，不能識別和糾正問題時。
（三）質控品測定
質控是保證檢測結果可靠性的一個重要手段，因此每批樣品的分析測定均應該有質控樣品同時監測。關于分析儀的批測定，是指一批樣品從開始測定到完成測定后停止的整個過程。其中如果進行了添加或更新試劑、進行了有可能改變吸光度的維護等操作，均應進行一次質控樣品的檢測，以便及時監測到分析系統的改變。
所有分析儀都已設定或固化了有關質控的分析程序，①設定有關質控參數，如每個質控品的批號、靶值和標準差；②選擇質控圖的方式，如均值－標準差質控圖；③質控結果的統計分析，分析儀會保存每次測定的質控結果，并對其進行統計，以列表或質控圖的形式在屏幕上顯示。可根據質控結果在質控圖上的位置判斷其是否在控。如果判為失控則應從試劑、質控品、校準品和分析儀等幾方面尋找原因。通過對質控結果的分析，也可以了解某項目的分析精密度和準確度的改變。
（四）檢測項目的輸入與測定
1．項目輸入
（1）逐項輸入：每份樣品可以任選分析儀中已設置的且試劑室內已預置試劑的項目中的一項、幾項或全部項目。
（2）項目組合輸入：把與疾病相關的檢驗項目組合在一起，進行組合檢驗，這有利于方便病人，有利于疾病的診斷和預后分析，同時也簡化了分析操作，提高分析效率。
（3）批量輸入：對于有連續相同測定項目的樣品，可使用批量輸入的方法。
2．進行測定 多數全自動分析儀的操作非常方便，在開始測定畫面，輸入該批第一個樣品的樣品號，分析儀即會自動逐個地對樣品進行測定。一般在開始畫面還有選擇：①是否需要對結果超過設定的線性范圍、超過允許的吸光度上限等的樣品自動進行重復測定；②測定結果是否需要按照已設定的打印格式自動打印與測定結果有關的選項。
3．急診檢驗 幾乎所有全自動生化分析儀都具備"急診優先"的功能，儀器留有急診樣品的分析位置或專用樣品架以及急診分析的專用編號。一旦在急診樣品位置上放置了樣品，并設定了急診檢驗的項目，分析儀就會在常規樣品的測定過程中，優先安排對該樣品進行分析測定。
（五）樣品的減量與預稀釋方式
當樣品中待測物濃度很高時，其結果往往會超過該項目的線性范圍上限。此時分析儀一般會進行自動減少樣品量重新測定。分析儀在結果計算時會自動按照樣品量的減少比例進行計算。樣品的預稀釋方式是指在分析過程中儀器首先對樣品做自動稀釋，然后進行測定。操作過程是，首先由樣品針吸取一定量樣品，加入反應杯，然后反應杯旋轉至加試劑位置，由試劑針吸取稀釋液加入已取樣品的反應杯，由攪拌針進行攪拌混勻，當再次旋轉至取樣位置時，由取樣針在已稀釋的反應杯里吸取已稀釋的樣品，加至另一個反應杯。前一個反應杯作為預稀釋樣品用，后一個反應杯將加入試劑產生化學反應用于測定。樣品預稀釋的優點在于，稀釋過程能自動化進行，能使用到高達100倍或更高的稀釋比例。但是每進行一次樣品預稀釋需占用3個取樣周期(sampling cycle)，使分析速度減慢。
（六）分析儀的維護
分析儀的常規維護(maintenanc)是保證分析儀能夠正常運行的重要手段。分析儀要嚴格根據操作手冊的要求進行維護，一般包括每天維護、每周維護、不定期維護等幾方面。
1．每天維護 ①清洗樣品針，試劑針，特別是攪拌棒容易纏上纖維蛋白，是最常見的交叉污染源。②加試劑。③加清洗劑。
2．每周維護
①執行比色杯清洗程序對比色杯進行清洗。這是由于比色杯經過反復使用后，會在比色杯內壁附有用常規方法難以徹底沖洗的物質，這些物質會引起交叉污染，通過使用專用的反應杯清洗劑能比較徹底地對這些附著物進行清洗。②對比色杯進行空白吸光度檢查，以了解比色杯經過一段時間使用后透光性的改變情況，以及光路系統的情況。③對于用恒溫水浴方式進行保溫反應的儀器，要對恒溫水槽進行清洗。
2．不定期維護 是指對一些易磨損的消耗部件進行檢查與更換。①檢查進樣注射器是否漏水，檢查各沖洗管路是否暢通，檢查各機械運轉部分是否工作正常。②比色杯是否需要更換。③光源燈是否需要更換。
（七）分析儀數據連網
分析儀的數據連網是指分析儀與實驗室網絡系統之間分析數據的互傳與共享。連網的實現是通過分析儀的數據接口以及接口軟件來完成，通過連網，能使來自分析儀的結果數據在網絡軟件的強大功能下得到進一步的處理，如報告單的格式（形式）更加為醫生與患者所接受；患者的信息與對應的檢驗結果能長期保存；結果的分析與管理更為完善。
三、自動化分析與手工操作的比較
與手工法相比，自動化分析具有許多優點，但也存在一些缺點。
（一）優點
1．檢測速度快。
2．檢測靈敏度高 由于分析儀采用了高靈敏的發光二極管等檢測器，使可檢測的吸光度達1.0-3.0甚至以上，多數在2.5以上，且吸光度可精確到0.0001。因而在符合郎伯－比爾定律的前提下，線性上限提高 。
3．檢測準確度高 分析儀能全過程檢測吸光度，因而能準確地判斷終點；使終點法結果準確，能做連續監測法使酶活性檢測更準確，以及各種自動監測判斷功能使檢測結果的準確性提高。
4．檢測精密度高 分析儀尤其是高檔分析儀，其取樣品和加試劑的精度高，人為誤差小，各類偶然誤差也小，使檢測精密度大大提高。
5．樣品和試劑用量減少 樣品用量減少的主要好處是在同樣采血量的前提下，可檢測項目增多；試劑用量減少則大大降低了試劑成本。
6．其他 ①能精確地控制反應時間，這對于連續監測尤其重要。②能精確地控制反應溫度，這對酶促反應特別重要。③能進行復雜的結果計算，如非線性計算，使非線性的檢測項目如載脂蛋白能得到準確測定。
（二）缺點
1．選擇次波長較困難 因分析儀無連續波長可選，因而選擇合適的次波長有時很困難。
2．操作時間受限 如各檢測項目加試劑時間只能統一固定在2到3個時間點，總反應時間只能固定在10min或15min等。
3．操作復雜性受限 ①加試劑的次數受限制，多數只能加1到2種試劑即單試劑法或雙試劑法，因而有些檢測方法無法在分析儀上測定，如改良J-G法測定血清膽紅素。需加三次或以上試劑的檢測項目就無法進行自動化分析。②無法做復雜的操作如檢測過程中的離心、過濾、萃取、煮沸等步驟，使有些檢測項目無法實現自動分析。③選擇和改變反應溫度困難。
4．樣品量/試劑量的比例受限制 由此影響了某些檢測項目的最低檢測限和線性上限。
5．做參考方法受限制 由于操作復雜性受限，以及反應過程中發生的現象難以觀察，不能中斷操作過程做一些靈活的操作改變等，因此操作復雜的參考方法一般由手工操作。
6. 儀器維護和保養較復雜。