抗原表位可以是由連續序列(蛋白質一級結構)組成或由不連續的蛋白質三維結構組成,決定抗原性的特殊化學基團,又稱抗原決定簇。抗原決定簇大多存在于抗原物質的表面,有些存在于抗原物質的內部,須經酶或其他方式處理后才暴露出來。一個天然抗原物質可有多種和多個決定簇。抗原分子越大,決定簇的數目越多。