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  • 發布時間:2019-03-28 11:26 原文鏈接: 從石蠟包埋固定的組織中制備RNA實驗

    該方案是由 Godfrey 等改進 Fisher 的方案發表的。此前已有從固定組織中純化 RNA 的方案發表。Ambion 和 Roche 發明了從石蠟包埋的組織中純化 RNA 的商品化試劑盒。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。

    實驗材料

    石蠟包埋的組織樣品

    試劑、試劑盒

    甲酰胺消化緩沖液乙醇肝糖異丙醇苯酚氯仿蛋白酶 KTrizol二甲苯

    儀器、耗材

    微量離心管恒溫箱

    實驗步驟

    一、材料

    1. 緩沖液、溶液和試劑

    去離子化的甲酰胺

    焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的水

    消化緩沖液(lmol/L 異硫氰酸胍,25 mmol/Lβ-巰基乙醇,0.5%N-月桂酰肌氨酸,20 mmol/LTris-HCl,pH7.5)

    乙醇,100% 和 70%

    肝糖

    異丙醇

    苯酚 (pH4.3): 氯仿(70%:30%)

    蛋白酶 K(60 mg/ml,20U/mg)

    Trizol(Invitrogen)

    二甲苯

    2. 特殊設備

    微量離心管,2 ml, 無 RNA 酶

    恒溫箱,預調至 37°C

    水浴或恒溫箱,預調至 55°C

    3. 細胞和組織

    石蠟包埋的組織樣品,切割為 5~50 張 5um 厚的切片

    二、方法

    1. 將組織塊置于 2.0 ml 微量離心管中,向樣品中加 1.8 ml 二甲苯。37°C 溫育 20 min。

    2. 稍微地離心樣品,移棄上清液再加入二甲苯,重復溫育和離心步驟。

    3. 用 0.5 ml 乙酵洗滌組織。移棄乙醇,風干。

    4. 加 80ul 蛋白酶 K(60 mg/ml,20U/mg) 和 72ul 消化緩沖液。55°C 下振蕩溫育過夜。

    5. 再次加 80ul 蛋白酶 K,55°C 下振蕩溫育過夜。次日再次加 80ul 蛋白酶 K, 再次 55°C下振蕩溫育過夜。

    6. 加等體積酚:氯仿,混合,在微量離心機中以最大轉速離心 5 min。將液相轉移到RNA 酶的新管中。

    7. 加等體積異丙醇和 2ug 肝糖,-20°C 放置 30 min。

    8. 在微董離心機中以最大轉速離心 30 min。移棄上清液,用 70% 乙酵洗滌沉降物。

    9. 在微量離心機中以最大轉速離心 30 min 并移棄上清液。風干沉降物,將之再溶解20ulDEPC 處理過的水中。加 500ulTrizol。遵循 Trizol 方案(見本章方案 3),對一處做修改:在第一次 Trizol 處理后,將液相轉移到無 RNA 酶的新管中,用 500ulTrizol 第二次處理樣品。

    10. 向第二次 Trizol 處理過的液相加 500ul 異丙醇以沉淀 RNA。

    11. 將 RNA 沉降物再溶解于 20ul 去離子甲酰胺中。-20°C 儲存 RNA。


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