1、偶見頭痛、頭暈、乏力、口干、共濟失調、輕度胃腸功能紊亂和皮疹。罕見有鎮靜作用。
2、偶見用藥中出現精神憂郁、心悸、失眠、肝功能失常、氨基轉移酶升高、月經失調、肌肉關節痛、出汗、肌顫、尿頻、視力障礙、皮膚感覺異常等，一般于停藥后均可自然緩解。少數患者對本藥過敏，主要表現為皮疹及瘙癢，應及時停藥并采取對癥處理。
3、近年來國外有報道用本藥患者出現心律失常、心電圖出現Q-T間期延長，甚至出現心跳驟停及猝死者，主要是由于本藥有心肌毒性作用，多見于超量用藥或肝功能不正常的患者。
4、有少數報道于特非那定用藥期間患者支氣管痙攣、意識障礙、脫發、失眠，但尚未肯定癥狀與服藥有關，但如一旦出現癥狀，應立即停藥，并檢測心臟功能。