5．清洗(WASH)系統
探針和攪拌棒采用激流式等方式自動沖洗。清洗裝置一般由吸液針、吐液針和擦拭刷組成。清洗工作流程為吸出反應一吸于一注入純水一吸干一擦干。清洗液有堿性和酸眭兩種。一般說來，在吸出反應液后，儀器先用堿性液沖洗，再用酸性液沖洗，最后用去離子水沖洗三遍。擦拭刷的功能是吸去杯壁上掛淋的水，刷體內部有負吸裝置。使用進程中要注意擦拭刷是否磨損。 檢驗地帶網
值得注意的是，對于常規沖洗還不能清除交叉污染(CARRY—OVER)的實驗要特別處理，以減少交叉污染或攜帶污染。例如，膽固醇測定試劑中的膽酸鹽對血清總膽汁酸的測定有干擾，在消除交叉污染的程序中，可輸入程序，指令總膽汁酸不在測試膽固醇的比色杯中進行測定，如不能避開，儀器則對比色杯進行特別沖洗，防止發生交叉污染。檢驗地帶網
沖洗水的水溫自動控制到與恒溫反應槽溫度相近，保證反應系統的恒溫，并增加去污力。急診測定后采用針對性清洗，似乎比采用固定的全面清洗程序更有效率更經濟。耗水量儀器間相差較大。 www.labdd.com
ABBOTT AEROSET 自動生化分析儀等系統具有自動清洗功能(SMART WASH)和最佳標本順序選擇功能(OSS)。即儀器根據試劑或樣品間交叉污染的項目組合，自動改變檢測順序，避免互有影響的分析項目；確實無法回避時，則采用選定的特殊清洗劑作自動清洗。
6．比色系統 www.labdd.com
(1)光源多數采有鹵素燈，工作波長為325～800NM。鹵素燈的使用壽命較短，一般只有1 000～L 500小時。當燈的發光強度不夠時，儀器會自動報警，應及時更換，部分生化分析儀采用的是長壽命的氙燈，24小時待機可工作數年，工作波長285-750NM。copyright labdd.com
(2)比色杯 自動生化分析儀的比色杯也是反應杯。比色杯的光徑0.5～0.7 CM不等，通常為石英或優質塑料。光徑小的省試劑，當比色杯光徑小于1 CM時，部分儀器可自動校正為1CM。生化分析儀的比色杯自動沖洗裝置在儀器完成比色分析后做自動反復沖洗、吸干的動作，比色杯在自動檢查合格后繼續循環使用。要及時更換不合格的比色杯。如采用的是石英比色杯，比色杯要定期檢查清洗。
(3)單色器與檢測器各類自動生化分析儀應用的是可見一紫外吸收光譜法，即監測200-700NM光區某特定波長下發色基團吸光度的變化，輔以微機軟件系統的計算來完成測定。可見一紫外吸光譜定量的基礎是LAMBER—BEER定律。 copyright labdd.com
傳統的分光度測定普遍采用前分光，即在光源燈和樣品杯之間先要用濾光片、棱鏡或光柵分光，通過可調的狹縫，取得與樣品“互補”的單色光之后，照射到樣品杯，再用光電池或光電管作為檢測器，測定樣品對單色光的吸收量(吸光度)。 本文來自檢驗地帶網
而現代大多生化分析儀采用后分光測量技術。后分光測定：將一束白光(混合光)先照到樣品杯，然后再用光柵分光，同時用一列發光二極管排在光柵后面作為檢測器。后分光的優點是不需移動儀器比色系統中的任何部件，可同時選用雙波長或多波長進行測定，這樣可降低比色的噪聲，提高分析的精確度和減少故障率。
生化儀的單色器即分光裝置，有干涉濾光片和光柵分光兩類。干涉濾光片有插入式和可旋轉的圓盤式兩種。插入式就是將需用的濾光片插入濾片槽中，圓盤式是將儀器配備的濾光片都安裝在圓盤中，使用時旋轉至所需濾光片處即可。干涉濾光片價格便宜，但易變潮霉變，從而影響檢測結果的準確性，半自動生化分析儀多采用此種濾光片。
光柵分光可分為全息反射式光柵和蝕刻式凹面光柵兩種。前者是在玻璃上覆蓋一層金屬膜后制成，有一定程度的相差易被腐蝕；后者是將所選波長固定地刻制在凹面玻璃上，耐磨損、抗腐蝕、無相差。全自動生化分析儀多采用光柵分光。