(1)有2個啟動子:P1和P2,當有活性的CAP存在時P1啟動,其-10順序位于-12~-6,稱為-10S1,轉錄的起始點為+1。當CAP缺乏時P2啟動子啟動,從-5開始轉錄,其-10順序位于-17~-11,稱做-10S2;
(2)gal操縱子無-35順序;
(3)具有2個操縱基因OE和OI ,OE在上游,位于CAP位點之內,OI在基因gal內部;無論是OE還是OI高啟動子都有一段距離,不直接毗鄰。
分析gal操縱子P(啟動區)-O(操縱區)區的DNA序列發現,該操縱子存在兩個相距僅5bp的啟動子,可以分別起始mRNA的合成。每個啟動子擁有各自的RNA聚合酶結合位點S1和S2。cAMP-CAP對從S1和S2起始轉錄有不同的作用。
從S1起始的轉錄只有在培養基中無葡萄糖時,才能順利進行,RNA聚合酶與S1的結合需要半乳糖、CAP和較高濃度的cAMP。從S2起始的轉錄則完全依賴于葡萄糖,高水平的cAMP-CAP能抑制由這個啟動子起始的轉錄。當有cAMP-CAP時,轉錄從S1開始,當無cAMP-CAP時,轉錄從S2開始。