整合抑制（integrative suppression）指由質粒等整合到染色體后產生的抑制。例如，在高溫條件下開始不具復制啟動能力的大腸桿菌突變型中，當F因子等一類能自主復制的單位（replicon）整合到上述突變型的染色體上之后，即可使原來寄主細胞的復制啟動機能的缺失而外觀上得到回復。這時隨著F因子的復制，在高溫條件下亦可見到大腸桿菌的復制活動。在這種情況下，如果F因子不整合到染色體，只是獨立存在于細胞中，則宿主染色體仍不能復制。這里F因子整合到染色體形成一條連續的DNA分子，是保證復制啟動的必要條件。