關于染色質免疫共沉淀的基本原理介紹

　　１、檢測目標基因活性

　　在保持組蛋白和DNA聯合的同時，染色質被切成很小的片斷，通過運用對應于一個特定組蛋白標記的生物抗體，將目標片段（組蛋白發生特異標記的片段）沉淀下來。ChIP是利用抗原和抗體的特異性結合以及細菌蛋白質的“protein A”特異性地結合到免疫球蛋白的Fc片段的現象合用開發出來的方法（免疫磁珠結合proteinA，proteinA結合抗體Fc段，抗體結合抗原即發生特異標記的組蛋白，這里要注意組蛋白是和DNA結合的，這樣就把目標組蛋白和DNA的復合體沉淀下來了）。再將組蛋白與DNA分離，用獲得的DNA去做PCR分析和序列測定等檢測技術，從而進一步檢測哪些基因的組蛋白發生了修飾。 [5]

　　２、檢測已知蛋白的靶基因

　　在生理狀態下把細胞內的蛋白質和DNA交聯在一起，超聲波將其打碎為一定長度范圍內的染色質小片段，然后通過所要研究的目的蛋白質特異性抗體沉淀此復合體，特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段，通過對目的片斷的純化與檢測，從而明確蛋白與哪些基因相互作用。