細胞學診斷最大的優越性在于能以形態學依據早期發現和診斷腫瘤，其操作及診斷方法簡便、安全、直觀，是目前任何其他術前檢查難以比擬的，針吸細胞學主要有以下優點：
1.一般不需特殊設備，易于在各級醫療部門開展。
2.細針穿刺近乎對機體無損傷，局部不遺留瘢痕，出血感染機會甚少，病人痛苦小，易于被病人接受。對深部病變以及神經，血管豐富的要害部位，FNAC具有更好的安全性和可行性。
3.涂片細胞新鮮，不易產生變性及自溶現象；細胞不易發生人為擠壓等損傷，形態結構清晰，有利于鏡下的準確識別和鑒別診斷。對于較典型的細胞學病例的診斷快速，通常病人立等可取其診斷結果。
4.對于某些一次陰性或可疑的診斷，可即時重復和多部位取材檢查，并便于隨診、動態觀察和療效觀察。
5.對病變的良惡性確診率高。具有較豐富經驗的臨床細胞學診斷醫師通常確診率可高達95%以上，病變分型確診率可達80%以上。
6.應用范圍廣，幾乎適用于機體的任何部位病變。通過X線、B超、CT和MRI等影象學定位引導下，可對身體各深部器官組織進行穿刺細胞學診斷。
7.吸出物為活組織，可用于其他的生物學實驗、細胞培養、免疫學及分子生物學等檢查。
8.與病理組織學檢查等診斷方法互為補充。
9.某些病變如乳腺囊腫，涎腺潴留囊腫等，穿刺可達治療作用。