因為其臨床表現非常典型，故鑒別的重點在于病因的分析。當然，在臨床中也存在一些疾病有類似的癥狀，容易產生混淆，但只要經過仔細的查體，對比兩側的感覺和運動功能，通過病史和查體可以做出脊髓半切綜合征的診斷。
應與常見的特殊類型的頸脊髓損傷進行鑒別：
一、中央型頸脊髓損傷：病變幾乎只發生于頸段，尚存骶部感覺和運動，感覺和上肢肌力減弱重于下肢是其臨床特點。
二、前脊髓綜合征：脊髓前綜合癥頸脊髓前方受壓嚴重 有時可引起脊髓前中央動脈閉塞 出現四肢癱瘓 下肢癱瘓重于上肢癱瘓 但下肢和會陰部仍保持位置覺和深感覺 有時甚至還保留有淺感覺。
三、后脊髓綜合征：多表現為雙側軀體深感覺和精細觸覺障礙，運動功能受損較輕。
四、脊髓橫貫損害：表現為脊髓病損水平以下的雙側肢體癱瘓，感覺缺失和膀胱、直腸、植物神經功能障礙。