盡管MAOI已逐漸被三環抗抑郁藥所取代,但對于恐怖、焦慮癥狀較重的病人,對三環抗抑郁藥無效的病人,MAOI具有較好療效。MAOI還被應用于抗帕金森氏綜合征治療,特別對于長期使用左旋多巴而發生耐受的患者,輔助MAOI可以提高療效。某些MAOI具有抗高血壓作用,內科用于治療中、重型高血壓。接受MAOI治療的患者可能合并外科疾患,難免需要進行手術與麻醉。