以下因素會影響同種異體骨移植后的排斥反應：
供體與受體的組織相容性：人類白細胞抗原（HLA）的匹配程度越高，排斥反應的風險越低。如果 HLA 差異較大，免疫排斥反應可能更強烈。
移植骨的處理方式：如深低溫冷凍、凍干、化學處理等方法的效果，處理得當可以降低骨的免疫原性，減輕排斥反應。
受體的免疫狀態：受體本身的免疫功能強弱會影響排斥反應的發生和程度。免疫功能亢進或存在自身免疫性疾病的患者，更容易出現強烈的排斥反應。
移植骨的大小和數量：移植的骨量越大、數量越多，引發排斥反應的可能性相對較高。
手術創傷和感染：手術造成的創傷大小以及術后是否發生感染，都會影響局部的免疫微環境，從而影響排斥反應的發生和發展。
術后用藥：術后是否規范使用免疫抑制劑、抗生素等藥物，對排斥反應有重要影響。
患者的基礎健康狀況：如患有糖尿病、營養不良、慢性疾病等，會削弱身體的免疫調節能力和組織修復能力，可能加重排斥反應。
心理因素：患者的心理狀態和精神壓力可能影響神經內分泌系統，進而間接影響免疫系統，對排斥反應產生一定影響。