基因測序揭示傳染病在醫院的傳播途徑

2011年6月至12月間，美國國立衛生研究院（NIH）臨床中心的17個病人，發生了血流感染事件，其中6人死亡。醫生得知其中一位6月住院的病人攜帶有克雷伯氏肺炎菌，但是不清楚這種被認為是醫院獲得性感染一個常見罪魁禍首的細菌，是如何傳來傳去或是否幾個不同的病人簡單地感染了該細菌。通過采集病人身上和某些醫院設備上的樣品，并對不同菌株的基因進行分析，研究人員追蹤了該病原體曲折的傳播途徑。

該項研究發表在《科學轉化醫學》上，是目前首例全基因組掃描技術在醫院暴發疫情期間的應用。

該論文的作者、美國國家人類基因組研究所高級研究人員Julie Segre指出，基因測序技術的應用成為可能，主要是因為其測試成本和速度足以實現近乎實時的測試。去年每個基因測試的成本為2000美元，今年已經跌到了500美元。基因掃描結果顯示病菌源于1個病人，其他病人通過醫院感染該病菌的途徑比預計的有所不同，此外現有的醫院獲得性感染的應對措施還不充分。與流行病學家預計的細菌從第一個病人跳到其他病人身上（此時有跡象表明此病人與第二個病人間發生了血液感染）不一樣，細菌的傳播方式更加復雜。分析顯示，1號病人將細菌分別傳給了3、4、8號病人，這些病人在1個多月后出現癥狀。8號病人身上攜帶的細菌并未進行進一步的傳播。而3號病人攜帶的細菌傳給了5號和2號病人，剩下的病人都是被4號病人所傳染。

研究人員認為細菌是通過醫院工作人員的手傳播。此外，在一個病人使用過的呼吸機上面發現了細菌，這表明常見的清潔程序尚不足以清除掉機器上的細菌。盡管在本次研究中并未發現細菌通過呼吸機傳播，但是這種事情可能在其他任何地方發生。