1.尿常規檢查 尿常規檢查是最簡便而可靠的診斷尿路感染的方法。宜留清晨第1次尿液待測，凡每個高倍視野下超過5個(>5個/HP)白細胞稱為膿尿。急性尿路感染時除有膿尿外，常可發現白細胞管型、菌尿，有時可伴鏡下血尿或肉眼血尿，尤其是在布魯桿菌、奴卡桿菌、放線菌、結核桿菌感染時。偶見微量蛋白尿，如有較多蛋白尿則提示腎小球受累。
值得一提的是，膿尿不等于表示尿路一定有感染，因為膿尿可被分為感染性膿尿和無菌性膿尿。無菌性膿尿可見于各種小管間質性腎炎。小管間質性腎炎病因廣泛，常見疾病有反應性小管間質性腎炎(即系統感染引起的小管間質性腎炎)、變應性小管間質性腎炎(許多藥物均可引起)、非甾體類抗炎藥物相關腎病、重金屬中毒性腎病、放射性腎炎、反流性腎病及各種特發性小管間質性腎炎。
2.尿細菌培養 以往認為，清潔中段尿培養菌落計數>10萬/ml才有臨床意義，<1萬>10萬/ml，但是僅有70%左右的革蘭陽性菌引起的尿路感染菌落計數超過10萬/ml，而另外20%～30%的患者其菌落計數僅有1000～10萬/ml，尤其是大多數下尿路感染者。菌落計數不高的原因有：
(1)尿頻尿急等刺激癥狀使尿液在膀胱內逗留的時間太短，不利于細菌的繁殖。
(2)已用抗生素治療。
(3)應用利尿藥使細菌不易生長繁殖。
(4)酸化尿不利于細菌生長繁殖。
(5)有尿路梗阻(如結石并感染)，菌尿排泄受限制。
(6)腔外感染。
(7)病原體為厭氧菌，不能被常規培養基培養出來。
(8)革蘭陽性細菌分裂慢，且有凝集傾向，菌落計數往往偏低。
因此，臨床癥狀符合尿路感染，且尿菌落計數在1000～10萬/ml時，也需考慮尿路感染。
3.菌尿的化學檢測方法 以往將尿培養細菌陽性和顯微鏡檢查有膿尿存在作為診斷尿路感染的標準。但是考慮到UTI普遍存在于各年齡組，以及著重強調在家庭或門診診斷并治療UTI。現有4種方法可作為菌尿的快速診斷工具。
(1)硝酸鹽還原法：迄今為止最為常用的仍是Griess硝酸鹽還原法。這種檢測方法對清晨第1次尿液的測定最為準確，而且還可相當準確地判斷感染是否為大腸埃希桿菌所致。但不能用于檢測革蘭陽性菌和假單胞菌屬所致的感染。由于尿液在膀胱中的停留時間對細菌還原硝酸鹽是必需的，在飲食缺乏一定量硝酸鹽或利尿時可出現假陰性結果。
應用專業廉價的試紙，聯合硝酸鹽法和白細胞酯酶法，在2min內便可得出結果，從而極大地提高了本方法的實用價值。這種檢測法對尿或膿尿中大腸埃希桿菌超過10萬個/ml有診斷價值，其陰性試驗結果的預期值為97%。在蛋白尿和尿中有慶大霉素或先鋒霉素存在的情況下，可出現假陰性結果。據報道這種試驗的敏感性為87%。特異性為67%(假陽性結果通常由陰道污物所致)。這種方法對有癥狀病人尿液標本的篩查比對無癥狀病人的篩查更為有效。
(2)氯化三苯四氮唑試驗：本試驗在攝入大量維生素C或尿的pH值<6.5時，可出現假陽性結果。如果試劑變質或感染是由鏈球菌、某些腸球菌和假單胞菌屬所致時，可出現假陰性結果。
(3)葡萄糖氧化酶法和過氧化物酶試驗：葡萄糖氧化酶法的原理是細菌可消耗存在于非糖尿病人尿中的少量葡萄糖，過氧化物酶試驗的原理是大多數尿路致病菌均有此酶，在任何疾病的炎性細胞中也有此酶。這兩種方法的準確性比前述兩種方法要差得多。
(4)浸玻片檢查法：此方法是將瓊脂涂在塑料平板的表面，并將平板浸入尿中，滴干尿液后，進行孵育，通常將對革蘭陰性菌有選擇作用的瓊脂涂于平板或玻片的一側，而對大多數細菌包括革蘭陽性菌生長無選擇作用的瓊脂涂于平板或玻片的另一側，經過一夜的孵育之后，在兩側瓊脂的表面均可見許多的菌落，可將其與標準菌落圖譜進行比較，即可半定量估計出尿中細菌的數量。陽性片還可進行菌種鑒定和藥敏試驗。這種技術常用于門診或家庭內篩選。
(5)半自動方法：有3種半自動方法可用于UTI的診斷。
①Bac-T-Screen法：這種方法是先將尿標本經濾紙過濾、染色、沖洗、再用比色計進行比色，這種技術能檢出尿中1萬個/ml細菌。其敏感性約為88%，但特異性僅為66%。其缺點是可造成儀器的堵塞，或因尿中其他有色顆粒物質的存在而影響其特異性。
②生物發光法：細菌產生的ATP，可利用螢火蟲的熒光素/熒光素酶的生物發光反應來檢測，用細菌ATP的量來反映細菌的數量。這種方法可檢查尿中細菌數臨界值為1萬個/ml，其敏感性約為97%，特異性為70%～80%，對尿檢測細菌陰性患者最有價值。此方法的陰性預期值大于99%。
③電子阻抗粒子計數法：這是一種非依賴于細菌增殖的方法，它能夠單獨檢測白細胞數。雖然目前這種方法有較高的假陽性率(20%～25%)，但仍是一種很有前途的檢測技術。
4.感染的定位檢查 雖然上下尿路感染臨床表現很相似，但對治療的反應和致病菌的類型卻有明顯的差別。膀胱感染在解剖定位上是一種表淺黏膜的感染，抗生素在該部位容易到達高濃度。相反，腎臟感染(男性的前列腺感染)則是一種深部實質組織的感染。由于機體生化環境的影響，使這一組織部位的自然防御能力減弱，同時能到達該部位的抗生素濃度也很有限。由于尿路感染解剖部位不同，治療尿路感染所需抗生素類型也不同。與膀胱感染相比，腎臟感染(和前列腺感染)需要一個更為有力或更長時間的抗菌治療。
由于有30%～50%隱匿性腎臟感染病人的臨床癥狀主要是以下尿路為主，因此不能單憑臨床表現進行定位診斷。尿路感染的定位檢查法有以下幾種：
(1)雙側輸尿管插管法：雙側輸尿管插管法是惟一直接對感染進行定位的診斷方法，雖然其損傷性較大，但與所有其他感染的定位診斷方法相比，仍最為準確。
(2)膀胱沖洗后尿培養法：損傷較小的方法是膀胱沖洗后尿培養法。這種方法的主要缺點是它不能區分腎臟感染是單側還是雙側。然而與所有非侵入性方法相比較，它具有易操作、安全、廉價且無需膀胱鏡專業人員的幫助，它已代替輸尿管插管法而作為感染的定位診斷方法。
這種方法是先插導尿管入膀胱，并留取尿作0號標本；然后用100ml生理鹽水加入抗生素(通常用新霉素或新霉素 多黏菌素)沖洗膀胱，再用200ml生理鹽水沖洗膀胱，排空后收集最后幾滴尿作1號標本；以后每隔15min分別收集2～5號標本。將0～5號標本進行細菌培養，結果判斷如下：
①0號標本菌落數>10萬/ml，表明患者存在細菌尿。
②1～5號標本無菌，表明為下尿路感染。
③2～5號標本菌落數>100/ml，并超過1號標本菌落數的10倍，表明為上尿路感染。
(3)尿濃縮功能的測定：通過最大尿濃縮功能的測定來評價腎髓質的功能，可用來區分腎臟和膀胱的感染。腎髓質部位的感染，可出現最大尿濃縮功能的改變。急性或慢性腎小管間質的炎癥常引起尿濃縮功能的減退，因而可應用最大尿濃縮功能來對其進行最佳的評價。腎盂腎炎出現尿濃縮功能的減退是由與炎癥有關的腎髓質部前列腺素的代謝紊亂所致，因為它可通過給予前列腺合成酶的抑制劑——吲哚美辛阻斷。有研究證實腎性菌尿與尿的濃縮功能下降有關，而膀胱性菌尿則與此無關，并且雙側腎臟感染者尿濃縮功能的減退要明顯大于單側腎臟感染者。對于單側腎臟感染者，他們可表現為受損側尿濃縮功能減退，而未受損側尿濃縮功能則正常。尿濃縮功能的恢復與感染是否根除有關。這種感染定位診斷方法的缺點是在膀胱感染、單側腎臟及雙側腎臟感染患者之間，常有交叉重疊現象。因此這種方法除操作不便之外，還因其敏感性差而不列為常規檢查。
(4)尿酶檢測：尿酶的檢測可反映小管炎癥損傷，而腎髓質部位的感染可出現腎髓質炎癥反應，因而尿酶增加。
25%腎盂腎炎病人出現尿乳酸脫氫酶(LDH)活性的升高，但有假陰性結果，而在血尿和重度蛋白尿時也可出現假陽性結果。現已發現腎盂腎炎患者的尿。β-葡萄糖醛酸酶活性明顯高于下尿路感染者。腎內感染者尿β-葡萄糖醛酸酶活性輕度高于膀胱感染者。然而，由于此酶活性在上述病人中有相當的重疊，故這種方法并非對每一患者都有定位診斷價值。測定腎小管細胞的N-乙酰-β-D-葡萄糖胺酶(NAG酶)也可對感染進行定位診斷，并認為此方法很有前途。腎盂腎炎患者尿肌酐水平為(906±236)mol/(h·mg)，而下尿路感染者尿肌酐水平為(145±23)mol/(h·mg)，正常兒童尿肌酐水平為(151.6±10)mol/(h·mg)。兒童腎盂腎炎抗生素治療有效時，尿NAG酶水平下降。令人遺憾的是在其他研究中發現，腎盂腎炎和膀胱炎患者尿NAG酶范圍也有相當的重疊現象。
因此，雖然檢測尿中腎小管細胞酶或抗原，對于UTI的解剖定位診斷很有希望，但對感染定位的最佳檢測方法仍需進一步探討。
(5)C反應蛋白的檢測：有報道認為應用免疫擴散技術檢測血清C反應蛋白，發現兒童腎盂腎炎患者C反應蛋白水平持續升高，而急性膀胱炎患者C反應蛋白水平則正常。動態觀察腎盂腎炎患者C反應蛋白水平的變化可作為評價療效的指標。但其診斷與膀胱沖洗的定位診斷結果不一致。由于在其他各種炎癥狀態下，C反應蛋白水平也可升高，因而可出現假陽性，且C反應蛋白量的變化與感染部位間無任何相關性。據我們的體會，這種方法對成人尿路感染的定位診斷，敏感性更差。
(6)細菌抗體的檢測：腎臟感染常伴有直接針對病原菌抗原的特異性抗體的合成，許多研究者試圖應用免疫學技術來解決UTI解剖的定位診斷問題。應用細菌黏附試驗發現，有癥狀急性腎盂腎炎患者血清中的抗體水平升高，并且其滴度隨著對抗生素的治療反應的有效性而下降。對癥狀不明顯的腎盂腎炎患者血清抗體水平也升高，而膀胱炎患者血清抗體滴度則正常。有研究者利用輸尿管插管 凝集素抗體檢測對感染進行定位研究證實，腎臟感染者凝集素抗體滴度明顯高于膀胱菌尿者。然而抗體滴度的變化范圍較大，且二組病人之間有相當大的重疊現象。所以，這種血清學方法的定位診斷價值也有限。
近年來，應用最為廣泛的感染定位技術是尿液抗體包裹細菌分析法(ACB法)。免疫熒光技術研究發現，來源于腎臟感染的細菌，抗體包裹試驗陽性；而下尿路感染的細菌抗體包裹試驗陰性。盡管隨著ACB法應用的進一步推廣，出現了一些問題，但其結果得到其他研究者的進一步證實，下面就有關這種方法的現狀作一綜合的評價：
①尿液標本被陰道或直腸菌群污染，腎病綜合征病人出現大量蛋白尿，和感染累及腎以外的尿道上皮(前列腺炎，出血性膀胱炎，膀胱腫瘤或插管所致的膀胱感染)，檢查結果可出現假陽性。
②有16%～38%的成人急性腎盂腎炎及大部分兒童急性腎盂腎炎可出現假陰性的ACB檢測結果。慢性腎盂腎炎患者ACB檢測準確性為≥95%。這可能與首次感染時，細菌侵入腎內10～15天后，ACB試驗才陽轉有關。而對重復感染者，由于其體內已有抗體反應的存在，故其ACB檢測結果的陽轉所需時間則要短得多。
③急性單純性UTI的女性，其ACB的陽性率在不同患者人群中是不同的。這些差異可能與就診的難易程度及癥狀出現與接受治療的間期長短有關。
④ACB陽性的人群對單劑量抗生素治療反應存在異質性。有50%～60%的ACB陽性的急性單純性UTI女性對這種治療有效，而對ACB陰性的急性單純性UTI女性，大約有95%的患者對這一治療有效。
綜上所述，ACB試驗不作為尿路感染定位診斷的常規檢查。故仍需繼續努力尋找更好的、非創傷性的UTI定位診斷方法。