CPS 是細胞莢膜的主要成分，可作為屏障保護菌體免受外界不利環境影響。O-PS 由重復寡糖單位組成，是脂多糖主要的致病因子，可幫助致病菌逃避宿主免疫系統的識別。對大多數致病菌而言，CPS和O-PS具有免疫原性，可刺激機體產生保護性抗體。這些多糖均屬于2型T細胞非依賴抗原（T cell-independent type 2，TI-2），進入機體后，通過與B細胞表面的抗原識別受體即表面免疫球蛋白分子（surface immunoglobulin mole?cules，sIg）交聯而激活 B 細胞，引起一系列下游變化，使B細胞分化為可分泌抗體的漿細胞，在整個免疫過程中并沒有T細胞的參與，因此不會形成免疫記憶，產生的抗體主要是親和力較低的IgM和IgG2
由于多糖的免疫原性，可將其制成多糖疫苗，主要是將特異性的多糖純化后制備而成。