基本上是一致的只是固定相存在差異。凝膠色譜法又稱分子排阻色譜法。凝膠色譜主要用于高聚物的相對分子質量分級分析以及相對分子質量分布測試。
凝膠層析又稱分子篩過濾、排阻層析,操作條件比較溫和,可在相當廣的溫度范圍下進行,并且對分離成分理化性質的保持有獨到之處。
兩者的共同點是都不需要有機溶劑。
凝膠色譜色譜一般用在HPLC等分析場合。而凝膠層析一般用在制備的時候。