實驗概要
本文介紹了強堿法小量制備質粒DNA的原理及操作流程。有助于了解基因工程操作中運載基因的載體,掌握最常用的提取質粒DNA的方法。
實驗原理
堿變性抽提質粒DNA是基于染色體DNA的變性與復性的差異而達到分離的目的。利用溶菌酶、強堿(NaOH)及表面活性劑(SDS)使細胞破壁、膜,釋放出胞內染色體DNA,質粒DNA及其它物質,通過一系列的純化過程:高鹽除核DNA,苯酚-氯仿抽提變性蛋白和脂類,最后用異丙醇(或乙醇)沉淀出質粒DNA和RNA等, RNA再經RNase消化,得到質粒DNA,這種質粒DNA可用作基因工程的載體,更廣泛地用于重組子的鑒定。
主要試劑
1. 溶液1(GTE)
50 mmol/l 葡萄糖
10 mmol/l EDTA-Na2
25 mmol/l Tris-Cl (pH 8.0)
4mg/ml 溶菌酶
2. 溶液2
200 mmol/l NaOH
1% SDS
3. 溶液3
5 mol/l KAC 60 ml
冰乙酸 11.5ml
ddH2O 28.5ml
4. 苯酚-氯仿
5. 異丙醇(或95%乙醇,100%乙醇)
6. 70%乙醇
7. TE (pH 8.0):
10 mmol/l Tris-Cl (pH 8.0)
1 mmol/l EDTA-Na2
8. RNase 1mg/ml
9. Amp 100ug/ml
主要設備
1. 37℃搖床
2. eppendorf管
3. 高速離心機
4. 低溫冰箱
實驗材料
Ecoli InvaF'(pUC19)
實驗步驟
1. 挑取一單菌落的Ecoli InvaF'(pUC19)菌種接種到含Amp100ug/ml的LB液體培養基中,37℃振蕩培養過夜。
2. 吸1.4ml菌液至eppendorf管中,在高速臺式離心機上5,000g離心2min,倒去培養基。
3. 重復1次,盡可能倒出培養基并將管倒置于紙帕上,以吸干管壁上殘留的培養基,收集細菌。
4. 將細菌懸于500ul冰冷的溶液1中,于離心機上5,000g離心2min。
5. 倒去溶液1,再懸于200ul冰冷的溶液1中。
6. 加入300 ul新配制的溶液2,冰浴5 min。
7. 加入300ul冰冷的溶液3,中和,輕輕振蕩10sec,至冰浴5 min。
8. 于離心機上,10,000 g離心5min。
9. 取上清轉移至一新管中,并加入RNase酶至50ug/ml,于37℃水浴中溫浴30 min。
10. 加入等體積的飽和酚抽提1次,10,000 g離心5min取上清液。
11. 再加入等體積的氯仿抽提1次, 10,000 g離心5min取上清液。
12. 加入750ul異丙醇,沉淀質粒DNA, 10,000 g離心10min。
13. 倒去異丙醇,用70%乙醇洗滌沉淀,10,000 g離心5min。
14. 置冰箱內開蓋干燥,懸浮至40ul去離子水或TE中。