1.抗感染治療
原則上應根據細菌學和藥敏試驗結果選用抗生素。可先用青霉素、阿米卡星，待細菌學和藥敏報告后再調整用藥。合并厭氧菌感染者可加大青霉素G劑量或加用林可霉素，甲硝唑口服。嚴重者可靜滴頭孢西丁等。在全身用藥基礎上可行局部治療，如經鼻導管或經纖支鏡氣管內滴藥等，阿米巴肺膿腫應用甲硝唑等抗阿米巴治療。
2.體位排痰和藥物祛痰
根據膿腫部位和病情采取體位引流，給予祛痰藥物口服，如必嗽平、沐舒痰等，必要時行超聲霧化。
3.經纖支鏡沖洗膿痰較多或有明顯痰液阻塞征象者
可行纖支鏡沖洗和吸引。加強支持治療，必要時少量多次輸血。
4.外科治療
經內科常規治療3個月以上仍咳膿痰、膿腔無明顯改變者，或合并威脅生命的大咯血或不能與肺癌等鑒別時可行手術治療。