質粒提取主要包括三個步驟：
1、菌體擴繁。
2、菌體裂解釋放質粒DNA。
3、質粒DNA的分離與純化。
質粒提取辦法中，最常用的是堿裂解法，它具有得率高，適用面廣，快速，純度高等特色。
其原理是：強堿（pH12.0-12.6）環境下，SDS損壞細胞壁并裂解細胞，一同使宿主細胞的蛋白質、染色體及DNA發生變性，而質粒DNA因為其分子量小而纏結嚴密不易變性。
pH調至中性時可恢復天然構象，在高鹽條件下，細胞碎片、變性的蛋白質和染色體DNA發生沉積，離心后可去除。
上清中的質粒DNA可經過乙醇沉積或許硅膠膜特異性吸附等方法，將質粒DNA從上清中回收。
