新生兒與嬰幼兒及兒童相比,通常有較衛生的護理,母乳喂養也可保護新生兒。然而,在衛生條件較差的地區或貧窮和擁擠的家庭中,更經常地發生腹瀉。醫院內也可有暴發流行,特別在擁擠的嬰兒室,糞口傳播幾乎為最常見的途徑。大多數新生兒感染是通過被污染的產道時或由父母,同胞及醫護人員的雙手而傳播,其他少見的原因有污染物或污染的奶制品。