機會性感染均在人體免疫功能低下時發生。人體免疫功能低下可見于以下情況。
① 皮膚和粘膜的表面屏障作用受到破壞。若皮膚、粘膜受到損傷，存在于皮膚表面的細菌侵入人體引起感染。例如大面積燒傷的病人，不但皮膚受到廣泛損傷，深部組織直接暴露在空氣中，而且人體的免疫功能（如巨噬細胞的吞噬和解毒功能、嗜中性粒細胞的殺菌功能等）下降，故極易招致感染。其他如靜脈插管以提供高營養的療法、留置導尿管、腦脊液分流術、普通外科手術及心臟外科手術等均可引起感染。
② 先天性免疫缺陷。可以是體液免疫缺陷，如先天性無γ-球蛋白血癥的患者，由于缺乏產生抗體的能力，常發生反復感染，尤其是細菌感染。細胞免疫功能缺陷的患者亦易感染。如胸腺不發育或發育不良的患者常有面容異常（眼距寬、兩耳低位畸形、魚形嘴），淋巴細胞（尤其是T淋巴細胞）減少，極易發生病毒、結核菌或真菌感染，也易患寄生蟲病如卡氏肺孢子蟲感染。嚴重聯合免疫缺陷癥患兒的T細胞及B細胞的免疫功能完全缺失，常在出生后1年內死于感染。患兒接種牛痘、麻疹疫苗或卡介苗后則易因全身性牛痘癥、全身性麻疹或系統性卡介苗感染而死亡。
③ 繼發性免疫缺陷。如晚期腫瘤病人的細胞免疫和體液免疫功能都明顯減弱，感染成為這種病人的最大威脅，患者易感染各種微生物，病原體以革蘭氏陰性細菌尤其是假單胞菌如綠膿桿菌較為常見。免疫抑制劑類固醇激素、抗代謝藥、烷化劑和葉酸拮抗劑等的應用常導致免疫缺陷，因此也常引起繼發感染。身體虛弱者及慢性病病人，也常出現免疫功能減退，較易發生感染。某些感染如麻疹、傳染性單核細胞增多癥等也常導致免疫功能低下。獲得性免疫缺陷綜合征由人免疫缺陷病毒（HIV）引起，病毒主要侵犯輔助性T淋巴細胞，使這種細胞的數量明顯減低，病人幾乎都死于繼發感染和腫瘤。此外某些抗生素的長期應用，可抑制正常的菌叢，而這有利于某些條件致病菌如真菌的生長，從而導致機會性感染。