果膠酶在果汁和葡萄酒工業中扮演著各種角色。它們用于果汁中的澄清，還可以通過果肉的酶促液化來加速果汁的提取。此外，果膠酶有助于果汁工業中果肉產品的形成。果膠酶用于從果泥中提取汁液。這是在果膠酶分解底物果膠并提取果汁時完成的。果膠酶降低了生產果汁所需的活化能并催化反應。
果膠酶通過從水果中提取花青素而在葡萄酒工業中很有用，有效地加強了葡萄酒的著色。果膠酶還可用于從植物細胞的細胞壁中提取汁液。
果膠酶也用于紡織工業中的漚膠。添加螯合劑或用酸預處理植物材料可增強酶的作用。
