(1)出血 主動脈縮窄術后早期最危險的是出血，尤其是病人術前有嚴重代謝紊亂導致凝血障礙者。出血可能是吻合口或側支血管殘端所致。術后需保持病人安靜。如有持續高血壓需選用降壓藥物。術后當天常規作床邊x線胸片檢查，嚴密觀察胸腔引流量和顏色。一旦發現有出血征象，應及時再次進胸探查止血。
(2)高血壓 術后暫時性高血壓是常見并發癥之一，多解釋為因主動脈縮窄，近端主動脈弓和頸動脈竇的壓力感受器長期處于高壓狀態下，一旦縮窄解除血壓下降后，壓力感受器可反射性提高血壓。一般數天后血壓逐漸恢復正常。術后早期采用適量的鎮靜劑和硝普鈉0.01-0.03ug/(kg.min)靜脈維持，大多病兒在術后3天內血壓逐步降至正常，僅3例病人需口服卡托普利(開搏通)1～3周維持。
(3)鄰近組織損傷 如手術時分離范圍過大或粘連較甚，解剖時常可損傷鄰近組織，包括喉返神經、膈神經。其次在游離主動脈峽部時損傷胸導管，術后出現乳糜胸。亦有報道在作鎖骨下動脈瓣翻轉術時發生臂從神經損傷。
(4)腹痛或縮窄切開術后綜合征(Post-Coarctotomy Syndrome) 在作縮窄切除術后伴高血壓的患兒中10%～20%可發生腸系膜炎。其癥狀類似急性壞死性小腸結腸炎。劇烈腹痛常伴腹脹和觸痛，有時可伴腹水、發熱、白細胞增多、潰瘍和黑便。治療可對癥處理，必要時胃腸減壓和靜脈補液。應用抗生素和類固醇對解除癥狀作用不大。控制高血壓可減少本癥的發生。
(5)截癱 Brewer等在1972年回顧了12532例主動脈縮窄手術病人，0.45%發生截癱。主要由于側支循環不多，術中主動脈阻斷為時過久或損傷較多的肋間動脈導致脊神經缺血。
(6)遠期并發癥
1．術后再縮窄 嬰幼兒主動脈縮窄術后再縮窄發生率可達9%～60%。Williams等隨訪191例端端吻合嬰兒術后情況，隨訪時間最長為15年，術后再狹窄發生率1年25%，5年42%，7年近54%。近年來采用鎖骨下動脈瓣翻轉術和應用可吸收縫線，術后再狹窄的發生率明顯降低。術后再狹窄宜用球囊擴張主動脈成形術解除或減輕主動脈縮窄術后再狹窄，求囊擴張術對原發主動脈縮窄的應用還未肯定。
2．假性動脈瘤 多發生于應用人造材料糾治術后，一般發生在人造補片的對側。
3．鎖骨下動脈竊血綜合征 表現為頭痛、偏盲和癲癇。預防方法是術中單獨結扎椎動脈。
近年來隨著手術方法的改進，主動脈縮窄手術早期死亡已明顯下降，單純型主動脈縮窄l歲時手術醫院死亡率為3%。合并其他心內畸形死亡率增加。早期死亡原因大多為嚴重的心肺功能不全。