腹痛為發作性，常在進食或冷飲后加重，排便排氣后減輕。腹瀉者糞便多為糊狀，可含粘液，但絕無膿血便發生。腹瀉多在早、晚餐前后發生，便意急。有的以便秘為主，有的為腹瀉與便秘交替發生。它與炎性腸病的最大區別是經檢查腸道無器質性病變。然而，腸易激往往與精神因素有關。焦慮、精神刺激可誘發或加重癥狀。
發病部位主要在臍周圍及左下腹部，臨床癥狀常出現不定時的疼痛，但排氣或排便后多可緩解；腹瀉或便秘，或二者交替出現。大便時常帶少許粘液，但極少有便血。便秘時大便堅硬往往如羊糞球樣。或一天解數次水樣便，但無明顯腹痛及不適感。其中部分結腸功能紊亂患者是繼痢疾，急性腸炎或非特異性結腸炎后而發病。
腸功能紊亂是老年人的常見病。人們會感到沒有食欲，身體倦怠，全身無力，甚至會導致心理負擔。由于結腸功能紊亂所帶來的不適與痛苦，常造成老年患者精神緊張，引起痙攣性便秘或大便頻數，出現腹痛并排出大量粘液，此時稱為粘液性結腸炎，但實際上并無炎癥。此癥在老年人中比較多見，這主要是因為老年人臟器功能衰退，又多牙齒不好，咀嚼能力差，胃酸和消化液分泌減少，消化功能減退之故。加之老年人中常患有萎縮性胃炎，糖尿病，慢性胰腺炎，結腸憩室，缺血性結腸炎，結腸腫瘤以及族維生素B缺乏癥等，因而更增加了引發結腸功能紊亂的機會。