氣質聯用儀是一個氣體運行的系統，因而儀器的密封性相當重要。
1.換柱：毛細管柱進入質譜腔中的長度不適當，太長或太短都不行。
2.墊圈要松緊合適，太松會有漏氣的隱患，太緊則會壓碎墊圈，每次更換色譜柱時需要更換新的密封墊圈。
3.清洗離子源時打開腔體后要注意其密封性。
