通常乙肝大三陽潛伏期是不需要用藥治療的，這是因為此時機體與乙肝病毒和平共處，還沒有造成肝損傷。因而處在乙肝大三陽潛伏期的患者，在這個時候只需要密切關注乙肝五項和肝功能檢查即可。
對持續HBV-DNA陽性、達不到上述治療標準，但有以下情形之一者，亦應考慮應用抗病毒治療來有效的治療乙肝：
①對ALT大于ULN且年齡﹥40歲者，也應考慮抗病毒治療乙肝；
②對ALT持續正常但年齡較大者（﹥40歲），應密切隨訪，最好進行肝組織活檢；如果肝組織學顯示KnodellHAI≧4，或炎性壞死≧G2，或纖維化≧S2，應積極給予乙肝抗病毒治療；
③動態觀察發現有疾病進展的證據（如脾臟增大）者，建議行肝組織學檢查，必要時應對乙肝給予抗病毒治療。