普歇理論
1859年法國博物學家、巴黎科學院通訊院士F.A.普歇（Felix Archimede Pouchet）發表“異源發生論或自然發生論”的論文與法國微生物學家L.巴斯德間又展開類似的爭論。F.A.普歇認為在具備有機物、水、空氣和適當溫度的條件下自然發生能被促進，并設計實驗企圖證明他的觀點。
巴斯德理論
巴斯德根據他從事發酵工作的經驗，認為“酵素”實際是生命有機體，并確信空氣中的微生物也來自酵素。1860～1861年L.巴斯德用火棉及S形長頸瓶進行實驗,證明空氣中的塵埃攜帶著各種微生物；而且隨著場所和高度的不同，空氣中微生物的含量也不一樣。他在高山上做實驗，由于高山上空氣新鮮，微生物及孢子少，所以酵母浸液受污染的機會也少。