雖可減輕癥狀，但不能預防復發，故應合理用藥，并避免濫用藥。
①抗膽堿能藥：如山莨菪堿（654-2）、貝那替秦（胃復康）等，因不良反應較多漸被其他藥物替代。目前推薦應用美貝維林（麥皮凡林）10mg；雙環維林10mg；吡芬嗅銨（prifiniumbromide） 30mg；口服3次/d。亦有應用西托溴銨（cimetropium bromide）50mg餐前服，取得良好效果。
②鹽酸醋丁洛爾（鹽酸醋丁酰心胺）：具有單一抗運動，無麻醉的抗膽堿能作用，用量為2mg，3～4次/d。亦可用可樂定（氯壓定）0.3～0.4mg，3次/d，口服，能促進小腸對液體物質吸收，增強結腸對電解質的吸收，以減慢小腸的轉運時間，有較好的止瀉效果。
③鈣通道阻滯藥：硝苯地平（心痛定）10～20mg或維拉帕米（異搏定）40mg，3次/d口服，可抑制胃結腸反射，緩解腹痛，減少便次。
④阿片類止瀉劑：洛哌丁胺（易蒙停）作用于腸壁的阿片受體，阻滯乙酰膽堿和前列腺素釋放，抑制腸蠕動，增加水、電解質吸收。每次口服2mg，2～3次/d，每天用量不得超過10mg。便成形后可漸減用量至停藥。有患者出現口干、腹脹，甚至呈假性腸梗阻等副作用。亦有服復方苯乙哌啶，本藥系哌替丁衍生物，除有止瀉效果外，尚有興奮中樞神經作用，大劑量有止痛和欣快感，長期使用有依賴性。
⑤微生態調節劑：是通過微生物學技術，將人體內正常菌群分離出來，經純培養后，進行工業化生產，制成益生菌制品，再按原途徑回歸人體，調整微生態失常，達到防治疾病增強免疫功能作用。微生態調節劑除有益生菌制品（Probiotics）外，尚有益生菌生長促進物質稱益生元（Prebiotcs）。益生菌制劑服后進入腸道，迅速定植于腸道黏膜，并迅速繁殖形成生物學屏障，分解葡萄糖產生乳酸，使腸道pH降低，抑制致病菌的繁殖生長，糾正腸道菌群失調，恢復和維持腸內微生物生態系統穩定，改變腸道運動功能。常益生菌制劑有：
A. 口服雙歧桿菌三聯活菌制三聯活菌制劑（培菲康）：為雙歧桿菌、嗜酸乳桿菌、糞鏈球菌等組成，對抗生素、化療藥物具有抵抗性的乳酸菌制劑，使患者服用抗生素、化療藥后，腸內菌群保持平衡，消除由菌群失調引起的一些癥狀。每次服2～4粒，2～3次/d。
B. 嗜酸乳桿菌（樂托爾）：主含嗜酸乳桿菌及其代謝產物，具有抑制腸道致病菌的生長，阻止細菌、病毒與腸絨毛黏附作用。每次1粒，口服3～4次。
C.聚克通：主要含嗜酸乳桿菌、乳酸乳桿菌、乳鏈球菌3種乳酸菌，對多種抗生素有抵抗性。每次2粒，3次/d。
D.佳士康（gastrferm）主要為活性糞腸球菌，能耐受多種抗生素。每次1～2粒，2～3次/d。
E. 酪酸梭狀芽孢肝菌（米雅BBM）：為宮入菌（酪酸菌）是芽孢厭氧梭狀桿菌，在體內不受胃酸、膽汁等影響，是一體內正常菌群，可阻止有害菌定植，糾正腸內菌群紊亂，每服2片（含宮入菌末40mg），3次/d。此外，尚有雙歧桿菌（麗珠腸樂）、地衣芽孢桿菌（整腸生）、雙歧桿菌（回春生）、乳酸菌素、乳酶生等，均屬此類藥物。
①飲食調整：進食有軟化和擴大糞便容積的食物，如粗纖維多的食物，適量多飲水，定時排便。
②西沙必利（普瑞博思）：通過興奮節前神經元的5-羥色胺4（5-HT4）受體，并作用于腸肌叢神經節細胞使乙酰膽堿釋放，增加胃腸推動力，促進排便。每次5～10mg， 3次/d餐前半小時服。
③乳果糖：口服15ml/d，可增加便次，使糞便變軟，緩解排便困難。但有過敏者應慎用。
④口服甘露醇2～4g，3次/d；或服葡甘聚糖1g，3次/d。
注意情緒與腹痛的關系，必要時暗示療法或局部熱敷、理療、按摩或封閉。近年報道鈣通道阻滯藥有良好作用，對胃腸平滑肌有松弛作用，尤其對食管及結腸作用為佳，腹痛者可試用硝苯地平（心痛定），及解痙鎮痛藥等。選擇性胃腸道鈣通道抑制劑能解除胃腸道平滑肌痙攣，抑制餐后結腸運動反應。對IBS患者腹痛治療效果較好，對腹瀉和便秘亦有一定療效。常用選擇性鈣通道拮抗藥有匹維溴胺（得舒特）5mg/次，3次/d；雙環維林（雙環胺） 10～20mg/次，3～4次/d；西托溴銨（cimetropitum bromide）50mg/次，3次/d，口服。