慎用抗生素
對于生殖道解脲支原體感染的治療，必須權衡利弊，慎重進行，不可過于積極。對解脲支原體感染者配偶或性伴的治療也同樣要慎重，關鍵是要針對可能合并存在的其它性病病原體感染。有許多解脲支原體感染者，長期使用抗生素治療，但解脲支原體檢查依然陽性，而且還出現了許多新的不適。究其原因，極為復雜，解脲支原體耐藥、檢測錯誤或試劑不過關、二重感染（長期應用抗生素者容易出現真菌、其它不敏感細菌感染）、心理因素等均可能存在其中。
一般而言，對衣原體感染有效的藥物對支原體感染也有效。而中醫治療的優點則在與無耐藥抗藥性，無副作用，可以配合御雪清等純中藥制劑治療。對女性盆腔炎，應考慮其多因素性，治療應包括針對淋球菌、沙眼衣原體、人型支原體及厭氧菌的抗生素，國外推薦頭孢西丁+多西環素或克拉霉素+慶大霉素的聯合治療方案。對于可能由支原體感染引起的前列腺炎，宜采用米諾環素治療，因為米諾環素能穿過前列腺包膜而在前列腺內達到殺滅支原體所需要的藥物濃度。值得提出的是，前列腺炎病因復雜，抗生素治療的效果并不一定好，需采用綜合療法，而且最好聽從泌尿外科專家的意見進行治療。
近來，解脲支原體對抗生素的耐藥性問題已引起多方注意，濫用抗生素可能是導致解脲支原體耐藥的重要因素。解脲支原體對四環素的耐藥株占10%～20.6%，對多西環素的耐藥株占8%～27.5%,對紅霉素的耐藥株占10%～52.4%。解脲支原體和人型支原體對氧氟沙星的耐藥株占近20%。
此外，對羅紅霉素及阿奇霉素耐藥的解脲支原體也有報告。由于解脲支原體對抗生素的耐藥性有日漸增加的趨勢，臨床用藥時應予以注意。有專家主張在治療解脲支原體感染時，為了減少或防止耐藥株的出現，宜采用2～3種不同類型的抗生素聯合治療。
一般治療
生殖道解脲支原體并非一定是性病，也并非都要治療。生殖道解脲支原體感染的治療要視具體情況而定，切忌急躁草率。
解脲支原體生長最適宜的pH值為pH6.0～6.5，生殖道的弱酸性環境能保持陰道的自潔功能，正常人為3.7-4.5，因此用Ph4弱酸配方的御雪清治療對解脲支原體的生長繁殖會有抑制作用。外出如廁時要用女性衛生濕巾拭干外陰，保持外陰干燥，以抑制解脲支原體的生長。
夫婦雙方應在準備懷孕前進行解脲支原體檢測，若存在解脲支原體感染，應于治愈后再懷孕；其次，妊娠早期檢測，若檢測為陽性，應及時治療，以免對胎兒構成損害。解脲支原體是一種通過性接觸傳播的疾病，也存在間接性感染，因此，夫婦雙方重視性衛生，日常的清潔用Ph4弱酸配方的女性護理液，杜絕不潔性生活，對預防解脲支原體感染具有十分重要的意義。