甲狀腺過氧化物酶（TPO）位于甲狀腺上皮細胞的頂端細胞膜上，直接參與甲狀腺細胞中的氧化、酪氨酸的碘化及酪氨酸的偶聯等。它是甲狀腺激素合成過程中的關鍵酶。近年來，通過免疫學、生物化學及基因重組研究，已證實TPO是甲狀腺微粒體（TM）的主要成分。TPO也是自身免疫性甲狀腺疾病（AITD）一種重要的自身抗原，可以刺激機體免疫系統產生抗TPO抗體（TPO-Ab）。TPO-Ab作為AITD一種重要的自身抗體，可通過激活補體、抗體依賴細胞介導的細胞毒作用和致敏的T殺傷細胞直接殺傷等作用機理，引起甲狀腺濾泡損傷，間接的抑制甲狀腺素的合成，導致甲狀腺功能減退。TPOAb陽性提示甲狀腺淋巴細胞浸潤以及甲狀腺細胞破壞。TPOAb滴度升高常預示甲狀腺功能異常，即使是在自身免疫性甲狀腺疾病的亞臨床階段。TPOAb除了在甲狀腺疾病診斷中具有非常重要的意義外，近年來還發現它與數種器官特異性以及系統性自身免疫紊亂密切相關。
1 惡性貧血：TPOAb與惡性貧血顯著相關。據統計，多達45％的TPOAb陽性者同時合并胃壁細胞抗體陽性，近50％惡性貧血患者可檢出TPOAb陽性。約14％的惡性貧血患者合并原發性甲減，而且原發性甲減患者的惡性貧血發病率遠高于一般人群。
2 糖尿病：自身免疫性內分泌疾病，尤其是1型糖尿病同時合并另一種自身免疫性內分泌疾病的概率很高。橋本氏甲狀腺炎與l型糖尿病是最常見的組合．約20％～40％l型糖尿病患者合并橋本氏甲狀腺炎。
3蕁麻疹：TPOAb慢性蕁麻疹的病情活動密切相關，目前研究認為慢性蕁麻疹與甲狀腺自身免疫疾病為關聯性疾病，TPOAb并非參與了慢性蕁麻疹的病理過程。而是TPOAb的滴度與機體免疫系統病理性激活的強度大致平行。可以反映機體非特異性免疫紊亂的程度。因此有學者建議，慢性蕁麻疹患兒應定期檢測TPOAb。
另外其他的一些自身免疫性疾病，如系統性紅斑狼瘡、類風濕性關節炎、炎癥性腸病等疾病中TPOAb的陽性率遠遠高于其他人群，這類病人合并甲狀腺疾病的幾率也較高，建議長期隨訪甲狀腺功能。