VP1蛋白質位于病毒體核心，是一種核糖核酸聚合酶。在被感染的細胞中，這種酶會產生病毒蛋白質合成所需的信使核糖核酸轉錄復本，以及產生輪狀病毒基因體核糖核酸片段拷貝來提供新產生的病毒體使用。
VP2蛋白質形成病毒體的核心層，并且結合核糖核酸基因體。
VP3蛋白質是病毒體內核的一部分，而且是一種稱為鳥苷酸轉移酶（guanylyl transferase）的酶。這種酶是一種加帽酶（Capping enzyme），也就是制作信使核糖核酸轉錄后修飾時候所用的5'端帽的酶。這個5'端帽保護病毒的信使核糖核酸免受核酸酶（以核酸為底物的水解酶）水解，使之能夠保持穩定。
VP4蛋白質位于病毒體的表面，突出來而成為一個刺突（spike）。它連接細胞表面的受體分子，并且驅使病毒進入那個細胞。在病毒有傳染性之前，VP4蛋白質會被一種可以在內臟發現的蛋白酶改變成VP5*蛋白質與VP8*蛋白質。VP4蛋白質決定了該病毒的毒性（Virulence），而它也決定了該病毒的P型。
VP6蛋白質形成殼體的體積。它是抗原性強的蛋白質，并且可以被用來分辨輪狀病毒的種類。這個蛋白質被實驗室用來進行輪狀病毒A種感染癥的各種測試上。
VP7蛋白質是一種建立病毒體外層表面的糖蛋白。扣除掉它在病毒結構上的功用之外，它也決定該病毒珠的G型。VP7蛋白質跟VP4蛋白質一樣，都被免疫力（immunity）當作是防止感染的途徑。