含載脂蛋白AI或/和載脂蛋白AII的高密度脂蛋白代謝一般認為LPAI比LPAI:AII具有更強的抗動脈粥樣硬化作用，而其中大LPAI對冠心病發生的危險更具預測價值[9-10]。早年，Rader[11]等報道，LPAI中的載脂蛋白AI分解速率快于LPAI:AII的載脂蛋白AI，但實驗過程中示蹤子經受了超速離心處理，不能區分HDL亞類。Lamarche[等對健康禁食者和經過5小時靜滴合成甘油三酯乳劑的個體進行研究，結果發現靜注乳劑造成血漿HDL中甘油三酯增加2倍，磷脂增加25%，而HDL顆粒大小沒有變化。富含甘油三酯的HDL比禁食者HDL清除更迅速。進一步研究顯示：富含甘油三酯的LPAI部分分解速率快于禁食者LPAI。富含甘油三酯的LPAI:AII部分分解速率與禁食者相比，沒有統計學差異。實驗首次表明富含甘油三酯的HDL促進了血漿載脂蛋白AI的代謝清除。臨床上觀察到高甘油三酯血癥患者往往伴有低血漿高密度脂蛋白膽固醇，可能與此有關。有學者在獼猴體內通過脂蛋白脂酶抑制劑誘導富含甘油三酯的HDL，同樣發現其載脂蛋白的部分分解速率成倍增加。在Lamanche研究中，靜滴乳劑后使HDL顆粒表面富含多不飽和脂肪酸磷脂（來自甘油三酯乳劑中的大豆油磷脂）引起HDL載脂蛋白AI不穩定和構形變化。這為上述部分分解速率的差異提供了一種解釋。已證實含有多不飽和脂肪酸的重組HDL顆粒中載脂蛋白AI對鹽酸胍變性穩定性較差，且apoAI構形發生變化。Tilly-Kiesi等觀察到LPAI和LPAI:AII中載脂蛋白AI存留時間相近。絕經后婦女血漿中總載脂蛋白AI分泌率較高，LPAI及LPAI:AII的載脂蛋白AI分泌率之間的差異接近統計學意義，而其清除率基本相似。很顯然，血漿HDL-C濃度增加是由于載脂蛋白AI產生的增多。這與Colvin[5]等的結果相符合。前已述及，小顆粒HDL單向轉變為較大顆粒HDL。但在HDL動力學研究還顯示，注入體內放射性標記的小或大LPAI有40%轉變為LPAI：LPAII，尚不清楚這是否為LPAI獲得了載脂蛋白AII分子的結果。不過卻提示HDL亞類在另一個水平的代謝復雜性，有待于進一步探討。