1、順面膜囊 (cis Golgi)接受來自內質網新合成的物質并將其分類后大部分轉入高爾基體中間膜囊，小部分蛋白質與脂質再返回內質網（駐留在內質網上）。其他如：蛋白的O-連接，跨膜蛋白的酰基化，日冕病毒的裝配也是在此。
2、中間膜囊（medial Golgi）多數糖基化修飾、糖脂的形成、多糖的形成。有很大的膜表面，增大了合成與修飾的有效面積。
3、反面膜囊（trans Golgi）ph比其他部位低。功能是蛋白質的分類與包裝以及輸出，“晚期”蛋白質修飾。并保證蛋白與脂質的單向轉運。
