黃海所：發現刺參免疫通路基因

　　燦爛弧菌（Vibrio splendidus）是刺參（Apostichopus japonicus）腐皮綜合癥的主要致病因素之一，嚴重危害刺參養殖產業的發展。

　　為篩選涉及燦爛弧菌侵染的刺參免疫基因，并探索這一過程的分子機制，中國水科院黃海水產研究所王印庚研究員領銜的課題組對燦爛弧菌侵染的抗性型和敏感型刺參的相關轉錄組和基因表達譜進行了系統分析。

　　研究人員使用轉錄組測序共獲取319,455,942個Reads，組裝成186,658個contigs。之后，對89,891個代表性的contigs（無異構體）進行聚類分析。接著采用DGE測序對基因表達譜進行分析（轉錄組測序和DGE測序項目均由聯川生物承擔完成）。相比于對照組，在細菌抗性組中鑒定出358個差異表達基因（DEGs），在細菌敏感組中鑒定出102個DGEs。參照文獻報道和來自BLAST，GO和KEGG的注釋信息，研究人員從DEGs中鑒定出30個假定的細菌抗性基因和19個假定的細菌敏感基因。此外，還找到了許多差異表達基因參與免疫信號相關通路，如細胞內吞作用，溶酶體，MAPK，趨化因子和ERBB信號通路。

　　參考文獻

　　Gao Q, Liao MJ, Wang YG, et al. (2015) Transcriptome Analysis and Discovery of Genes Involved in Immune Pathways from Coelomocytes of Sea Cucumber (Apostichopus japonicus) after Vibrio splendidus Challenge. Int J Mol Sci 6(7), 16347-16377.

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