AtlasTM cDNA表達距陣(Expression Array)
同時對588種/1176種關鍵基因做全景表達圖譜分析
同時對大量已知基因的表達進行大規模高通量(High-htroughput)分析
檢測關鍵基因在細胞關鍵功能中的角色
只需簡單的雜交步驟
就在數年前,核酸矩陣技術只能在資金雄厚的大實驗室開展。但兩年前(1997),隨著Clontech公司推出AtlasTM cDNA矩陣,情況大為改觀。現在,cDNA矩陣已廣泛應用于生命科學的諸多領域如功能基因組研究、新藥開發和分子診斷等等。
Atlas?是世界上第一個商品化的高通量地分析基因差異表達的產品。它精心挑選生命現象中扮演關鍵角色的多個基因,并按基因功能分類點于一張膜上。
為提高信噪比,AtlasTM采取許多巧妙措施,如:
⑴.每個基因選取其特異性的cDNA片段,大小在200-600bp之間(最適于雜交的大小);
⑵.不含重復序列、同源序列和poly-A區;
⑶.經過擴增后,以管家基因進行均質化(normalization)點于膜上;
⑷.膜上還帶有作為陰性對照的大腸桿菌或者噬菌體基因。
每個kit含兩張膜(588個基因)或四張膜(1176個基因),所以兩個不同來源的mRNA樣本可以在一次實驗中進行比較。通過雜交獲取膜上的588個基因或1176個基因在兩組mRNA樣本中的差異表達。每張膜至少可以重復使用3次。
另外,Atlas?提供一種ZL的合成雜交探針新方法。在第一鏈合成過程中,使用ZL的基因特異性引物而不是使用oligo(dT)或隨機引物,這就降低了探針的復雜度,進而提高了約10倍的靈敏度,減少非特異性背景,而且可以用total RNA代替mRNA作為探針合成的模板。
Atlas?的另外一個優點是:探針既可以用32P標記,也可以用33P標記。二者的區別:33P探針雜交圖象質量很高,但是價格昂貴,而且靈敏度低;32P卻非常適于低豐度基因表達的檢測。
近年來,Clontech公司不斷推出新研究熱點的cDNA Array,您可以通過其公司網址上網查詢有關資料,也可以向ebiotrade.com客戶服務部索取。
Atlas? Human cDNA Expression Array Cat#7740-1
人類功能基因組研究的有力工具
包括許多在不同生命過程中起關鍵作用的基因
結果信息量大
588種人類cDNA點于一帶正電的尼龍膜上,另外還包括9個管家基因和質粒、噬菌體等陰性對照。cDNAs按功能分類置于不同板塊。
人類基因組計劃大規模測序得到幾千種基因的部分序列,雖然許多基因已經被歸于不同的功能類,但是他們在生物學過程中所起的真正角色還不是太清除,而要明白這些的一個重要步驟就是確定基因表達型(如比較基因在不同組織或不同進化階段的表達)。
Atlas? 不僅提供cdNAs list,也提供GenBANK的準入號。
Atlas? Human Cancer cDNA Expression Array Cat#7742-1
監測治療后分子生物學