根據分子生物學的中心法則,遺傳信息是從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質,其為活體生物中遺傳信息的解碼和翻譯提供了一種簡單的解釋。
當然在現實中,這一過程比近60年前DNA雙螺旋結構的共同發現者、諾貝爾獎得主Francis Crick首次提出的要遠遠復雜得多。其一,有多種類型的RNA,其中的三種——信使RNA(mRNA)、轉移RNA(tRNA)和核糖體RNA(rRNA)對于正確的蛋白質生成至關重要。此外,在轉錄過程中合成的RNAs往往還要經歷后續的改變,這被稱作為“轉錄后修飾”。
盡管多年來已發現了多種這樣的RNA修飾,但其中許多RNA修飾的功能和意義仍然是未解之謎。其中最常見的一種轉錄后修飾就是“假尿嘧啶化” (pseudouridylation),在此過程中尿嘧啶核苷(U)化學結構發生改變形成假尿嘧啶核苷(ψ)分子。到目前為止,已在tRNA、rRNA、snRNA中發現了大量的ψ,然而人們認為ψ不存在于mRNA中。
現在由Whitehead研究所和Broad研究所的科研人員組成的一個研究小組,利用一種先進的高通量測序技術ψ-seq,繪制出了廣泛的、高分辨率ψ位點圖譜,證實假尿嘧啶化確實自然存在于mRNA中。在9月11日的《細胞》(Cell)雜志上,研究人員詳細地描述了這種新方法和令人驚訝的研究發現。
論文共同第一作者 Douglas Bernstein 說:“這真是一種更好的檢測這種修飾的定量方法,其本身非常的有趣。在mRNA中發現這種修飾是一個意外的收獲。”
Bernstein與Broad研究所核心成員Aviv Regev實驗室的博士后Schragi Schwartz和Max Mumbach合作,在酵母中繪制出了這一ψ圖譜。在mRNA中的幾十個位點發現假尿嘧啶化之后,該研究小組開始著手確定這種修飾的功能作用。
知道假尿嘧啶化是由假尿嘧啶合成酶(pseudouridine synthases,PUS)所催化,該研究小組檢測了正常的野生型酵母菌株以及PUS基因刪除的突變株中mRNA假尿嘧啶化之間的差異。有趣的是,他們發現在正常酵母菌株中熱休克可顯著增高mRNA假尿嘧啶化位點的數量。并且,相比于遺傳改造的酵母菌株,在野生型酵母菌株中假尿嘧啶化基因的表達水平要增高近25%。
綜上所述,這些結果表明了在酵母中熱休克激活了一種動態的假尿嘧啶化程序,有可能通過提高不利條件下mRNA的穩定性給生物帶來了益處。
盡管研究人員是在酵母中闡析mRNA假尿嘧啶化的作用,這種方法學和研究結果對人類也有可能具有重要意義。作為這項研究工作的組成部分,科學家們對一組人類細胞進行了ψ-seq,證實人類和酵母細胞之間的mRNA假尿嘧啶化位點驚人的相似。值得注意的是,包括先天性角化不良在許多的人類疾病都與PUS基因突變相關,表明ψ-seq或可應用于揭示RNA假尿嘧啶化在人類疾病中的影響。
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