當細胞死亡后,其并不會消失地無影無蹤,相反其會以游離DNA的形式留下一下“指紋”痕跡,而在人類機體中,這些小型的DNA片段就會在血液中被發現;近些年來游離DNA的研究領域應運而生了一種稱之為“液體活檢”的新技術,該技術可以診斷并且監測某些癌癥,鑒別出胎兒機體異常,并且評估移植器官的健康性,進行這些操作僅需要簡單的抽血就可以完成,盡管這些檢測潛力巨大,但目前其所檢測的范圍卻非常有限。
發表在Cell上的一篇報道中,華盛頓大學的科學家就表示他們開發了一種新方法可以克服當前液體活檢技術的局限性,從而就以幫助鑒別出哪些類型的細胞可以產生游離DNA;這種方法可以擴大液體活檢的檢測范圍,其依賴于對個體機體中游離DNA的片段譜系進行分析,同時將這種譜系信息同細胞多種死亡生理條件進行對比。
研究者Shendure說道,我們的研究表明,通過觀察游離DNA的片段譜或許就可以幫助鑒別出產生游離DNA的特殊組織,而這種方法替代了直接尋找DNA特殊突變的方法;新型檢測技術可以對每個DNA片段的末端進行檢測,并且找到DNA的熱點區域;為了“裝入”細胞核,DNA就必須進行卷曲,不斷折疊形成緊密的包裹形式,而該過程的關鍵就是名為核小體的結構,核小體是由DNA和組蛋白組成的染色質基本結構單位,其在整個基因組中以串聯形式排列,就好像細繩上的珠子一樣,機體中的每個細胞都會以不同方式將DNA緊密壓縮,而這些差異性就給每個細胞游離DNA帶上了一定的標記。
研究者假設他們可以利用這些“指紋”來追溯游離DNA的來源,而為了完成這項工作,他們首先必須知道DNA的哪些部分纏繞在核小體上的;在細胞死亡期間DNA就會被酶類切割成小片段,而研究者表示,在人類基因組中很有可能存在1300萬個核心體的位置。利用癌癥患者的血液樣本,研究者就發現,不同的癌癥類型可以在游離DNA上產生不同的核小體指紋,對于某些癌癥患者而言,研究者就可以鑒別出腫瘤的解剖學來源。
大多數的液體活檢技術都會尋找機體中不同細胞間的特殊DNA錯配,比如存在于腫瘤細胞但不存在于健康細胞的突變等,研究者認為這種新型檢測技術的優勢就在于其甚至可以對遺傳特性相當的兩個細胞進行有效區分;目前這種新技術可以對液體活檢不能診斷的一系列疾病進行檢測,而研究者希望新型檢測技術可幫助進行諸如心臟疾病、中風及自身免疫等疾病的診斷。
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