頭顱CT或MRI檢查可發現部分患者的尾狀核頭部、殼核以及大腦皮質萎縮，腦室擴大，尾狀核萎縮程度與疾病的嚴重程度有關。PET檢查發現患者腦內局部葡萄糖代謝率（local cerebral metabolic rate of Glucose，LCMRGlu）在基底節明顯減少。也有研究提示，HD在臨床作出診斷的前幾年已出現基底節代謝異常。應用fMRI檢測能較早發現異常。[1]
