問題和解答
1. 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳時預電泳是怎么回事的?預電泳時要加6×DNA上樣緩沖液嗎?電泳1-2小時再加結合反應產物嗎?
預電泳是除去凝膠中沒有聚合的單體和雙體和聚合引發劑,提高分辨率,不加任何物質,一般30-60分鐘后加樣電泳。
2. 銀染的步驟是什么?銀染的關鍵因素是什么?
步驟是:
(1) 固定:10%冰乙酸min。
(2) 清洗:雙蒸水沖洗凝膠次,每次1min。
(3) 染色:染色液(1g硝酸銀,.5mL37%甲醛,1L雙蒸水。現配)染色30min。
(4) 清洗:迅速洗凝膠次。
(5) 顯影:30g碳酸鈉,1.5mL37%甲醛,200uL 10mg/L硫代硫酸鈉。顯影至清晰帶紋出現。
成功銀染的關鍵因素包括:
(6) 用超純水(比如,NANOpure或Milli-Q純化)或者是雙蒸水作銀染。
(7) 用提供的碳酸鈉或者ACS試劑級的碳酸鈉。
(8) 在染色后,水清洗所用時間的長短很重要,用不超過5-10秒的時間清洗膠,然后放入顯色溶液中,一般在水里浸一下就好。
(9) 甲醛和硫代硫酸鈉(ul/1ml)在使用前,及時加入到顯色液中。
(10) 在使用前及時配染色液。
3. 變性PAGE的上樣緩沖液配方?如何準備上樣的蛋白?是將細胞用超聲破碎,還是用細胞裂解液,大多細胞裂解液中均含有SDS,不知有沒有用于非變性
PAGE 的裂解液.具有操作步驟是什么?
非變性的PAGE buffer就是0.5xTBE,上樣緩沖液可以用普通的loading buffer,含有Tris,溴芬蘭以及甘油即可,甘油是主要的沉淀作用成分。都可以自己
配。細胞超聲即可,超聲后離心取上清.也有配NATIVE-PAGE gel所用buffer為1*TBE,用的running buffer也是1*TBE。還有一點就是要在配gel時考慮能使蛋
白多聚體穩定的因素。
4. 做了naive---PAGE沒有條帶,蛋白質是純品,分子量很大,怎么回事呢?
因為分子量很大,8%的膠濃度較合適。加樣時加個marker,可以檢測膠制備是否有問題。銀染方法比較靈敏,如果蛋白是一種酶,且可使某種底物顯色的話,可以用活性染色試試,更靈敏。
Native-PAGE注意幾個問題
1. 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳的過程中,蛋白質的遷移率不僅和蛋白質的等電點有關,還和蛋白質的分子量以及分子形狀有關,其中蛋白質的等電點是最重要
的影響因子,要根據蛋白質的等電點來選擇對應的電泳緩沖系統;
2. 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳的過程中,要注意電壓過高引起發熱而導致蛋白質變性,所以最好在電泳槽外面放置冰塊以降低溫度;
3. 蛋白質的分子量較大,則電泳時間可以適當延長,以使目的蛋白質有足夠的遷移率和其它的蛋白質分開,反之亦然;
4. 變性樣品的離子強度不能太高(I<0.1mM)。調整樣品的PH在4.0左右,這對于能否做好非變性樣品非常重要。上樣BUFFER 中沒有SDS之外,加入樣品后不能加熱.