1、注意本機的使用環境條件和電源；
2、機蓋開關要輕，以防損壞蓋鎖；
3、嚴禁工作時打開機蓋；
4、定期用中性肥皂水清洗樣品槽，嚴禁使用強堿、有機溶液和高濃度酒精擦洗；
5、有故障時請有專業知識的維修人員或廠家技術人員維修。
不同的類型的儀器各有什么不同的特點：
1、金屬板式實時定量基因擴增儀，還可作為普通PCR儀使用，有的甚至帶梯度功能，可容納的樣本量大，無需特殊耗材，但溫度均一性欠佳，有邊緣效應，標準曲線的反應條件難以做到與樣品完全一致。
2、離心式實時定量基因擴增儀的PCR擴增樣品槽被設計為離心轉子，溫度均一性好，但可容納樣品量少，有的需用特殊毛細管作樣品管，增加了使用成本，也不帶梯度功能。
3、各孔獨立控溫的定量基因擴增儀的不同樣品槽分別擁有獨立的智能升降溫模塊，各孔獨立控溫，適合多指標快速檢測，可實現任意梯度反應，但上樣不如傳統方法方便，而且需要獨特的扁平反應管，使用成本較高。