牛津納米孔測序將全面升級,回避IlluminaZL之戰
一直以來,牛津納米孔公司對其核心產品的微通道都持有保密態度,然而自測序巨頭Illumina公司對其進行ZL訴訟之后,牛津納米孔透露了其最新設備的驅動因子——細菌孔隙,似乎有意回避Illumina的ZL之戰。 納米孔測序被譽為是一個比傳統測序更便攜和實惠的技術,根據單核苷酸通過孔隙產生的電流變化來檢測DNA的序列,2014年,牛津納米孔推出了第一款商業化的納米孔測序儀——MinION。雖然研究人員稱贊該技術并為提高其準確性而不斷努力,但對MinION的孔隙結構一無所知。 2月23日,Illumina公司起訴牛津納米孔公司使用細菌驅動孔隙——恥垢分枝桿菌孔蛋白A(Mycobacterium smegmatis porinA,MspA)侵犯了Illumina的ZL。對那些擔心失去納米產品或擔心ZL之戰會扼殺新平臺發展的研究人員而言,本次訴訟是一個非常痛心的消息。巴爾地摩約翰霍普金斯大學的生物醫學工程師 Winston Timp......閱讀全文
美國批準“納米孔測序”新冠檢測試劑EUA
紐約 ?-美國食品藥品監督管理局上周授予美國實驗室公司緊急使用授權,用于基于納米孔測序的檢測SARS-CoV-2的試劑。 該試劑被稱為Clear Dx SARS-CoV-2 WGS v3.0測試,使用牛津納米孔技術的MinIon測序儀和Clear Labs Clear Dx自動樣品制備和分析流
納米孔直接RNA和cDNA長讀長測序概述
RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中,轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本,可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時,cDNA測序也極大
170萬!復旦大學納米孔測序儀招標項目
項目概況 復旦大學納米孔測序儀 招標項目的潛在投標人應在復旦大學采購與招標管理系統(網址為:https://czzx.fudan.edu.cn)獲取招標文件,并于2023年12月21日 09點30分(北京時間)前遞交投標文件。 一、項目基本情況 項目編號:1069-234Z20234618
納米孔直接RNA和cDNA長讀長測序概述
RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中,轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本,可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時,cDNA測序也極大
新型納米孔器件有望用于表觀遺傳學快捷測序
新華社布魯塞爾5月9日電(記者潘革平)比利時校際微電子中心(IMEC)9日發表公報說,該中心成功開發出一種能直接讀取單分子DNA(脫氧核糖核酸)堿基的新型光學納米孔器件,有望用于遺傳學研究快捷測序。 據介紹,新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術,能以超高分辨率,實現無標記檢測DN
科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法
長期以來,直接讀取蛋白質的一級結構存在許多困難。科學家通常會根據基因序列和氨基酸密碼子表來“破譯”蛋白質的氨基酸序列。由于轉錄后修飾和翻譯后修飾等生命活動的存在,氨基酸序列破譯結果并非完全正確,甚至與真實序列有很大差異。近期,荷蘭科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法,該技術能夠讀取蛋白質信息內容,
英一公司稱研發出納米孔基因測序技術
早上起來刷個牙,就能順便檢測自己有沒有患癌癥或者老年癡呆的危險。這種便利方式離我們不遠了。英國一家公司首席技術官克萊夫·布朗24日在一次醫學會議上說,借助納米孔基因測序技術,有望很快實現測序儀微型化,從而使它們“無處不在”,持續監測我們的健康狀況。 納米孔基因測序技術采用微
一種全新的高精度納米孔蛋白測序法
長期以來,直接讀取蛋白質的一級結構存在許多困難。科學家通常會根據基因序列和氨基酸密碼子表來“破譯”蛋白質的氨基酸序列。由于轉錄后修飾和翻譯后修飾等生命活動的存在,氨基酸序列破譯結果并非完全正確,甚至與真實序列有很大差異。近期,荷蘭科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法,該技術能夠讀取蛋白質信息內容,
納米孔測序聯合光學測繪揭示轉基因植物細節
索爾克的研究人員利用最新的DNA測序技術,在分子水平上研究植物插入新基因后會發生什么。 索爾克的研究人員繪制了具有最高分辨率的轉基因植物系基因組和表觀基因組圖,為了精確地揭示插入一段外源DNA后,在分子水平上會發生什么。他們的研究結果發表在2019年1月15日的PLOS Genetics,闡明
科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法
長期以來,直接讀取蛋白質的一級結構存在許多困難。科學家通常會根據基因序列和氨基酸密碼子表來“破譯”蛋白質的氨基酸序列。由于轉錄后修飾和翻譯后修飾等生命活動的存在,氨基酸序列破譯結果并非完全正確,甚至與真實序列有很大差異。近期,荷蘭科學家開發出高精度納米孔蛋白測序法,該技術能夠讀取蛋白質信息內容,
第三代高通量測序技術簡介——納米孔
??? 第一代Sanger法為DNA測序打開了大門,但它高昂的費用限制了在大規模測序工程上的使用。當今發展迅猛的第二代高通量測序設備,包括Illumina的Solexa、Roche 454系列以及ABI的SOLiD系統等,使測序費用大幅降低到60-1美元/megabase。 它們共同的缺點是
新型納米孔器件有望用于表觀遺傳學快捷測序
比利時校際微電子中心(IMEC)9日發表公報說,該中心成功開發出一種能直接讀取單分子DNA(脫氧核糖核酸)堿基的新型光學納米孔器件,有望用于遺傳學研究快捷測序。 據介紹,新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術,能以超高分辨率,實現無標記檢測DNA中的遺傳編碼以及表觀遺傳變異。研究近期發
哪些因素影響納米孔測序儀的重復性?
掌上測序儀好不好?用過才知道。最近,五個試用了Oxford Nanopore MinION測序儀的實驗室評估了儀器的重復性,并在開發標準操作和參考數據。這些實驗室屬于MinION分析和參考聯盟(MARC),該聯盟由MinION早期試用計劃的參與者組成。目前,第一階段的結果已經發表在開放獲取期刊
正在崛起的三代測序|牛津納米技術2018營收翻倍
2019年7月9日,著名的第三代測序儀器商牛津納米孔(Oxford Nanopore)表示其收入在2018年增長了246%,從2017年的1780萬美金增長至去年的4370萬美金。 2018年的訂單也較之前增加了一倍多,從上一年的2450萬美元增至6060萬美元。此外, 2019年的訂單量依舊
武大聯合團隊開發納米孔靶向測序-快速“捕獲”新冠病毒
武漢大學聯合團隊創新性開發了納米孔靶向測序檢測方法(NTS),能大幅提升病毒陽性檢出率,并能實現當天同時檢測新冠和其他10大類、40種常見呼吸道病毒并監測病毒突變。 3月7日,該團隊在預印版平臺medRxiv發表題為《納米孔靶向測序精準全面檢測新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究論文。 既往
nanoporetech-使用納米孔測序技術的微生物學
完整的細菌,真菌和病毒(DNA或RNA)基因組,可進行長時間的納米孔測序。通過快速的病原體檢測方法(無論是在實驗室還是在野外),從環境或單一生物樣品中鑒定并鑒定微生物。如果需要,還應附有抗菌素耐藥性分析。使用直接RNA或cDNA方法對全長轉錄本進行測序,以進行準確的基因表達和轉錄本亞型分析。?通過長
首次!納米孔測序讓流感病毒終于“無所遁形”|-Nature
4月12日,這項研究的領導者、美國疾病控制和預防中心(CDC)的微生物學家John Barnes在給bioRxiv服務器(生命科學領域專有的預印本文獻庫)的預印本(a preprint posted)中介紹了這項工作,他說:“我們第一次可以真正開始觀察基因組在其原始狀態的本質,這確實開始開辟了很
2016國家自然科學基金:納米孔測序技術
來自國家自然科學基金委員會的消息,8月17日國家自然科學基金委員會公布了2016年國家自然科學基金申請項目評審結果,其中面上項目16934項、重點項目612項、創新研究群體項目38項、優秀青年科學基金項目400項、青年科學基金項目16112項、地區科學基金項目2872項、海外及港澳學者合作研究基
納米孔測序重大升級,超高準確度,向臨床診斷邁進!
近年來,第三代基因測序技術發展迅速,在基因組學研究以及臨床疾病診斷領域備受青睞。該領域上游企業英國Oxford Nanopore Technologies(以下簡稱“ONT”)因其測序技術在樣本處理以及成本等方面占據較大優勢,而受到國內基因測序服務企業的鐘愛。相較于二代測序,三代測序技術擁有單分子無
拉曼光譜應用:新型光學納米孔器件有望用于快捷測序
比利時校際微電子中心(IMEC)9日發表公報說,該中心成功開發出一種能直接讀取單分子DNA(脫氧核糖核酸)堿基的新型光學納米孔器件,有望用于遺傳學研究快捷測序。 據介紹,新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術,能以超高分辨率,實現無標記檢測DNA中的遺傳編碼以及表觀遺傳變異。研究近期發
1.39億美元!全球測序巨頭Oxford-Nanopore獲知名機構投資
牛津納米孔總部位于英國,公司研發、生產和銷售世界上唯一的便攜式、實時DNA/RNA測序儀。此次募得資金主要用于公司下一階段的業務擴張,其中,包括在牛津建設一個全新的、高產能的生產基地,以滿足市場對牛津納米孔測序儀產品日益增長的需求;以及擴大服務位于全球70多個國家客戶的市場和銷售團隊。 同時,
納米孔ZL之爭落下帷幕
美國國際貿易委員會近日發布文件稱,Illumina公司和英國牛津納米孔公司的官司已經庭外和解。納米孔公司同意不再出口或售賣包含氨基酸序列納米孔的產品,并銷毀目前庫存的產品。但該文件也明確表示,這些限制不會影響牛津納米孔對CsgG的使用。CsgG是相關訴訟開始后不就,牛津納米孔發布的另一種新孔,基于全
新突破!掌上測序儀首次完成人類全基因組測序
最近,英國牛津大學(Oxford University)Wellcome Trust人類遺傳學中心(Wellcome Trust Centre for Human Genetics)和在基因組分析領域領先的英國公司Genomics plc宣布,首次使用掌上納米孔測序儀完成了多個人類全基因組測序和
中國科學家提出納米孔糖測序技術路線圖
基于在納米孔糖測序這一前沿方向的率先探索和重要進展,中國科學院上海藥物研究所研究員高召兵、副研究員夏冰清團隊應邀對納米孔糖測序的發展和應用前景進行展望,給出了納米孔糖測序儀器的設計方案,并首次系統性提出了可能的納米孔糖測序路線。相關綜述發表于《化學科學》。糖類結構的精準解析是研究糖類在生命過程中的作
利用納米孔測序技術揭示基因表達的染色質調控基礎
作為染色質的基本單元,核小體由大約147 bp的DNA和組蛋白八聚體(H2A, H2B, H3和H4)組成。核小體的動態定位和折疊組織會產生兩種不同的染色質狀態:“開放”(open)和“閉合”(closed)。核小體的定位和染色質狀態的動態變化對以DNA為模板的生物學過程(比如,轉錄、DNA復制
國產納米孔測序儀市場化加速,這家企業做對了什么?
“目前,已有超過100個機構使用齊碳QNome測序平臺。”?在6月28日舉行的新品發布會上,齊碳科技聯合創始人謝丹博士回顧了公司商業化探索的第一項成績單。QNome-3841是齊碳科技研發的國內首款商業化納米孔測序儀,在2021年12月正式面市,隨后被迅速應用到疾病控制與預防、病原體研究、動物疫病防
INCSeq:提高納米孔測序準確性的新方法
新加坡基因組研究院(GIS)的研究人員開發了一種方法,稱為INC-Seq,能夠提高牛津納米孔技術公司掌上測序儀MinIon的測序準確性。目前他們正努力改進該方法,將它應用到復雜樣本的16S測序、RNA測序以及基因組復雜區域測序等中。 研究人員在近日發表于《Giga Science》的文章中描述
基因測序新貴在ZL訴訟期間發布新技術
面對啟迪公司的訴訟,牛津納米孔技術公司表示,這種名為CsgG的微小孔隙是其新設備的基礎。 首創了一種名為納米孔測序的新DNA分析技術的英國牛津納米孔技術公司,對其產品的核心部分一直守口如瓶。不過,緊隨一項來自測序行業巨頭——啟迪公司的ZL侵權訴訟,該公司揭示了驅動其最新設備的東
一臺筆記本電腦、一個USB!科學家在南極完成了測序
在過去的幾年中,研究界和商業界已經開始開發能用于野外現場研究的測序儀,牛津納米孔技術就是典型的例子之一。牛津納米孔公司的MinION測序儀是這幾年備受矚目的一款手持式納米孔測序商業設備,去年人家可是上過太空的,它也是唯一上過太空的測序儀。如今,科學家們又僅憑一臺MinION設備、一臺便攜式電腦就
基因測序新貴在ZL訴訟期間發布新技術
首創了一種名為納米孔測序的新DNA分析技術的英國牛津納米孔技術公司,對其產品的核心部分一直守口如瓶。不過,緊隨一項來自測序行業巨頭——啟迪公司的ZL侵權訴訟,該公司揭示了驅動其最新設備的東西,即一種看上去巧妙避開了啟迪公司挑戰的細菌孔。 同此前方法相比,納米孔測序在分析DNA方面更加便捷和廉價