兩篇Nature子刊發表基因組測序成果為新藥開發提供新線索
科學家們對造成盤尾絲蟲病的寄生蟲進行基因組測序，揭示了這種寄生蟲的活動方式，鑒定了可以被現有藥物靶標的蛋白，為新藥和疫苗開發提供了線索。這項研究以兩篇文章的形式發表在本周的Nature Microbiology雜志上。 據世界衛生組織（WHO）統計，全世界有一千八百萬人受到盤尾絲蟲病的影響，主要集中在撒哈拉以南的區域。這種疾病通過在河流邊生活的蚊蟲在人群中傳播，這些蚊蟲叮咬會帶來致病的盤尾絲蟲。盤尾絲蟲進入人體就會開始繁殖，其后代遷移到皮膚會引起劇烈瘙癢和皮疹，遷移到眼睛會造成眼部癥狀甚至失明。目前人們普遍用抗寄生蟲藥物伊維菌素進行治療，但完全治愈可能需要數十年時間。一些研究者認為，伊維菌素的廣泛使用會使寄生蟲對藥物發展出抗性。 美國NIH過敏與傳染病研究所(NIAID)的研究人員收集厄瓜多爾、烏干達和西非的盤尾絲蟲（O. volvulus），對其完整基因組進行了測序，還重建了盤尾絲蟲體內共生菌Wolbachia的基因組......閱讀全文
新突破！掌上測序儀首次完成人類全基因組測序
最近，英國牛津大學（Oxford University）Wellcome Trust人類遺傳學中心（Wellcome Trust Centre for Human Genetics）和在基因組分析領域領先的英國公司Genomics plc宣布，首次使用掌上納米孔測序儀完成了多個人類全基因組測序和
人類基因組測序先驅欲進軍生物醫療測序領域
J. Craig Venter(中)希望通過利用基因組學實現對抗衰老的目標。 美國人類基因組測序先驅J. Craig Venter將和其新創立的公司Human Longevity Inc.(HLI)進軍生物醫療測序領域。HLI是“基因組學和細胞的診斷與治療公司”，計劃于今年夏季啟動，終極目
國內首個菊花腦基因組測序納米孔測序再發高分論文
菊屬植物種類繁多，又含多種栽培種，兼具觀賞和藥用價值，且染色體組結構從2n=18到8n=72之間，十分復雜，多年來難以攻破。 中藥所所長陳士林研究員、副研究員宋馳博士等利用ONT平臺解析了可能代表栽培菊屬祖先基因組的二倍體菊花腦基因組，分析表明其演化受重復序列爆發和近期WGD事件的驅動，該基因
突破耐藥基因組測序缺陷－靶向測序對抗耐藥菌新契機
自以抗生素為代表的抗菌劑問世以來，細菌對人類健康的危害得到了極大的控制。然而進入21世紀后，情況好似走入了另一個極端——由于抗生素濫用所致的耐藥菌的出現以及廣泛傳播。這是由于在藥物的選擇壓力下，敏感菌株被抑制或殺滅，天然耐藥或獲得性耐藥菌株則繼續生存、繁殖和克隆傳播，導致細菌的耐藥性增高。 細
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲，地理分布廣，感染率高，寄生于人體盲腸，導致人體慢性感染，對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
個人基因組測序收費將大幅降價
新華社倫敦2月9日電針對個人的基因組測序服務剛出現時，測序費用高達上百萬美元，普通人望塵莫及。不過，美國一家公司計劃從今年6月開始，推出低價個人基因組測序業務，顧客只需支付5000美元，就可向這家公司預約基因組測序服務。 據英國《新科學家》雜志網站報道，這家名為“完全基因組”的公司位于美國
個人基因組測序預測能力遭質疑
一項新的研究給全基因組測序對每個人都很有用的說法潑了一盆冷水。圖片來源：N.J. Roberts等，《科學—轉化醫學》 ?“每個人都將擁有自己的基因組序列，并且可以將這些信息裝在一個U盤中”——生物醫學家曾這樣給我們描繪一幅美妙的藍圖，當脫氧核糖核酸（DNA）測序變得很廉價時，這一
中藥材“甘草”基因組測序完成
日本理化學研究所、千葉大學、高知大學和大阪大學等組成的一個研究小組宣布，他們對中藥材“甘草”進行了全基因組測序，成功取得了推測的全部基因94.5%的基因信息。 甘草是一種豆科植物，廣泛應用于各種中藥中，是重要的中藥原料。它具有改善肝功能、治療消化性潰瘍、抗炎癥及止疼止咳等多種功效。甘草根部富含
The－scientists盤點最熱門的基因組測序
The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點，以饗讀者。 一種新病毒 種屬：果蝠皰疹病毒（FBAHV1） 基因組：149,459bp 日本北海道大學的研究團隊測序了一種新病毒的基因組序列，并將結果發表在六月十八日的Journal of Virology雜志上。
我國率先完成菊花全基因組測序
中國中醫科學院中藥研究所和安利植物研發中心對外發布消息稱，由他們共同發起的科研團隊，在菊花全基因組計劃獲重大進展的同時，還完成了重要的藥用菊花品種——杭白菊的全長轉錄組遺傳信息發掘。此舉使我國成為世界上首次完成菊屬植物菊花全基因組測序的國家。 據了解，菊屬植物染色體結構復雜，包含從2n=18到
人類基因組測序的緣起
雖然公眾對于開展人類基因組測序已經翹首以待，但是為這項計劃舉辦的首次協調會卻令人泄氣。1984年夏季，美國能源部（DOE）健康與環境研究項目主任查爾斯·德利西（Charles DeLisi）召開了專家會議，旨在評估人類基因組測序技術的可行性。自20世紀80年代早期以來，能源部的研究人員一直在致力
法國擬建高速基因組測序分析平臺
法國總理菲利普17日在巴黎宣布，法國在法蘭西島大區（又稱“巴黎大區”）和中部奧弗涅—羅訥—阿爾卑斯大區啟動建設兩個高速基因組測序分析平臺，以推動法國基因組相關研究的發展。 法國政府去年6月提出“法國基因組醫學2025”計劃，這兩個基因組測序分析平臺的建設就隸屬該計劃，預計將于2018年正式開始
Nature－Methods發布基因組測序新工具
十月十七日Nature Methods雜志發表的一項研究顯示，新測序技術與新算法的結合可以為人們揭示復雜基因組的詳細信息。加州大學戴維斯分校和Pacific Biosciences公司的研究人員的FALCON-Unzip算法能夠將長讀取測序數據裝配成高度準確、連續和正確定相的二倍體基因組。 隨
印度實施大規模基因組測序計劃
據4月19日《印度教徒報》消息，印度將實施一項涉及1萬人的基因組測序項目，以便進一步開展相關疾病防治研究。 2003年人類基因組首次被測序，開啟了將個體特定基因與疾病相關聯的新途徑。包括囊性纖維病、珠蛋白生成障礙性貧血等在內的近萬種疾病與單個基因故障有關。同時基因還可能對特定藥物具有不同敏感性
Nature新聞：基因組測序追蹤超級病菌
研究人員通過基因組測序最終了解了去年困擾英國劍橋一家新生兒特護病房達數月之久的超級細菌疫情。他們將這一案例報告在11月14日的《柳葉刀傳染病》(Lancet Infectious Disease)雜志上，標志著首次科學家們通過測序病原體基因組積極控制了一場持續爆發的疫情。 在兩天內Ro
中藥材“甘草”基因組測序完成
科技日報東京10月27日電 （記者陳超）日本理化學研究所、千葉大學、高知大學和大阪大學等組成的一個研究小組宣布，他們對中藥材“甘草”進行了全基因組測序，成功取得了推測的全部基因94.5%的基因信息。 甘草是一種豆科植物，廣泛應用于各種中藥中，是重要的中藥原料。它具有改善肝功能、治療消化性潰瘍
基因組測序的方法和臨床應用
基因組測序主要有兩種方法?鳥槍法?和克隆重疊群法。臨床全外顯子測序是針對人類全部基因的外顯子進行檢測，適用于一些難以判斷病因的復雜遺傳病的診斷，是一種常用的基因組測序方法。
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
近期最受關注的基因組測序研究
想象一下有人遞給你一杯奶昔，要你鑒別出里面所有的東西。或許你能夠辨別出有一點點的草莓或是酸奶的味道。但總體上它的味道就像是無法分辨的成分構成的混成品。 現在再想象一下，這杯奶昔是由來自大腦的2萬個碾碎了的細胞所組成。你可以通過測試來確定樣本中有什么分子，這就是科學家們現在所做的事情。這當然會提
首個蕨類植物基因組測序完成
蕨類植物是地球上最多樣化的植物種群之一，也是僅有的沒有完成基因組測序的主要植物種群。2018年7月18日，美國康奈爾大學研究人員在《自然-植物》期刊上發表了其完成蕨類植物基因組測序的結果。 蕨類植物的基因組較大，可以擁有多達720對染色體，包含多達1480億個堿基對的DNA序列（Gb）。相比之
我國率先完成棗樹全基因組測序
在科技部“十一五”和“十二五”科技支撐計劃項目的持續資助下，河北農業大學劉孟軍教授研究團隊在世界上率先完成了棗樹的高質量全基因組測序，組裝出總長4.38億個堿基的棗基因組序列，達估測基因組的98.6%，使棗樹成為世界鼠李科植物（近千種）和我國干果樹種中第一個完成基因組測序的物種。 相關論文
近期最熱門的基因組測序成果
大千世界無奇不有，這都是進化的功勞。大航海時代，科學家們揚帆遠航去探索大自然的神奇造化。如今，科學家們正在測序技術的幫助下進一步揭示生命的奧秘。The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點，華大基因參與的兩項測序研究格外引人矚目。 種屬：長頸鹿和okapi 基因組
PacBio完成大型基因組測序項目
什么叫PacBio技術應用到大型基因組測序項目中會大打折扣，在哪個環節大打折扣?提出這個問題的讀者幾乎都是抱有同樣的心態，盡管大多數讀者都基本認同了，如果為了得到Finishing Genome，那么PacBio無論技術和成本，理論上都是最低的，但即使這樣，客觀成本還是高的嚇人，而假如將就D
我國完成首個魚類基因組測序項目
記者8月5日從深圳華大基因研究院獲悉，中國水產科學研究院黃海水產研究所和深圳華大基因研究院已聯合完成半滑舌鰨全基因組測序和組裝，繪制了半滑舌鰨全基因組序列圖譜。這是我國完成的第一個魚類基因組測序項目和全基因組序列圖譜，使半滑舌鰨成為世界上第一個測定了全基因組序列的鰈形目魚類。 據了解
PacBio助力感染菌株基因組重測序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遺傳與基因組中心的副主任。他目前領導著一些專攻治療和診斷的合作項目，而他自己的研究也主要在病原體檢測，藥物基因組學，睡眠與遺傳的關系幾個方面展開。在加入西奈山之前，他曾經就職于PacBio，Sage Bionetworks和Merck。他有
簡述全基因組測序的技術路線
全基因組測序的技術路線：提取基因組DNA，然后隨機打斷，電泳回收所需長度的DNA片段（0.2~5Kb），加上接頭, 進行DNA簇（Cluster）制備，最后利用Paired-End（Solexa）或者Mate-Pair（SOLiD）的方法對插入片段進行測序。然后對測得的序列組裝成Contig，通
華大基因發布基因組測序新成果
來自深圳華大基因研究院的研究人員，對4種代表性的彈涂魚（mudskippers）進行了基因組測序，由此闡明了兩棲魚類適應陸地生活環境的分子機制。相關研究論文發布于12月2日的《自然通訊》（Nature Communications）雜志上。 深圳華大基因研究院的石瓊(Qiong Shi)研究員
Nature：實時、便攜式基因組測序
埃博拉病毒（EBOV）感染人類會引起致命的出血熱，發病率和病死率極高。2014年這種病毒在西非造成了嚴重的疫情，死亡人數已經超過11,000人。今年一月份，就在人們以為這場疫情正式結束之際，塞拉利昂又出現了新的病例。 本期Nature雜志發表的一項新研究展示了便攜式基因組測序儀在這次疫情中起到
埃博拉基因組測序發布重要發現
來自巴斯德研究所（Institut Pasteur）、法國國家科學研究中心和悉尼大學的科學家們，通過對在幾內亞流行的埃博拉病毒株進行基因組測序，追蹤了病毒的傳播，并監測了這一國家的病毒進化情況。 研究揭示出有三種不同的病毒變種在幾內亞，尤其是首都的城市區域和附近的市鎮同時傳播，研究人員在發表
當宏基因組遇上單細胞測序
日前，科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性，但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上，研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本