草莓和可可樹基因組圖譜出爐
據美國物理學家組織網12月26日報道，在26日出版的《自然—遺傳學》雜志上，兩組科學家表示，他們分別解開了野生草莓和克里奧洛可可樹的基因密碼，新發現有助于育種專家培育出品質更高的草莓和可可樹品種。 英國生物工藝學和生物學研究委員會(BBSRC)和其他4個國家的70名研究人員繪制出了野生草莓完整的基因組圖譜，研究發現，野生草莓共有約3.5萬個基因，是人類基因數量的1.5倍，野生草莓的大部分基因也出現在人工培育的草莓品種中。研究人員首先將野生草莓的基因組分割成數百萬個短小的片段，然后給每個片段排序，接著將所有片段組合起來，從而繪制出了野生草莓完整的基因組圖譜。 該研究小組的研究人員丹·薩杰表示：“幾百年來，農民一般采用雜交育種的方式來改進農作物的特性，雜交草莓的基因組圖譜更復雜，但野生草莓的基因數相對比較少，我們能更容易得到所有有用的基因。” 該研究團隊的研究員、美國俄勒岡州立大學的托德·莫克勒表示：“科學家可......閱讀全文
草莓和可可樹基因組圖譜出爐
據美國物理學家組織網12月26日報道，在26日出版的《自然—遺傳學》雜志上，兩組科學家表示，他們分別解開了野生草莓和克里奧洛可可樹的基因密碼，新發現有助于育種專家培育出品質更高的草莓和可可樹品種。 英國生物工藝學和生物學研究委員會(BBSRC)和其他4個國家的70名研究人員繪制出了野生草莓
首個草莓完整基因組發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494423.shtm草莓是薔薇科植物，在世界范圍內被廣泛栽植。其約有25個種，倍性十分豐富，從二倍體到十倍體均有。森林草莓作為草莓二倍體模式種，有很大的研究價值。2018年GigaScience發表了利用
日破譯人工栽培草莓基因組
日本研究人員27日報告說，他們破譯了人工栽培草莓的基因組，這一成果將有助于開發更好看好吃并能抵抗蟲害的新品種草莓。 位于千葉縣木更津市的上總DNA研究所在英國《DNA研究》雜志網絡版上介紹說，研究人員將人工栽培草莓品種“麗紅”的染色體DNA序列分成片段，分析堿基對的排列，并與4種野生草莓進
草莓甜度可控啦－基因組編輯能精細調控草莓糖分含量
無性繁殖植物在農業生產中具有重要地位，但是長期無性繁殖導致性狀多樣性的嚴重匱乏極大阻礙了無性繁殖作物的育種發展。在育種設計中，對數量性狀的精細調控可以避免產生劇烈的性狀變化，并且可以極大豐富性狀多樣性，對推進精準育種有重要意義。基因組編輯技術通過對調控元件的遺傳操作可以實現對數量性狀的改良。對于
Nature－Genetics：多種技術解析草莓基因組
近日，美國密歇根州立大學和加州大學戴維斯分校的研究人員組裝出近乎完整的栽培草莓基因組，并揭示了這種復雜的異源多倍體的起源和進化過程。 一轉眼又到了草莓上市的季節。這種小巧可愛的果實有著酸甜可口的味道，可搭配出各種各樣的美妙滋味。不過，對于草莓的基因組，你又了解多少？ 世界各地廣泛種植的鳳梨草
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
研究解析栽培草莓“祖先”的基因組圖譜
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507227.shtm草莓具有重要的經濟和營養價值，現代八倍體栽培草莓起源于兩個八倍體野生種弗州草莓和智利草莓的種間雜交。近日，中國科學院昆明植物研究所研究員朱安丹專題組深入解析了八倍體草莓的起源和遺傳分化
研究解析栽培草莓“祖先”的基因組圖譜
草莓具有重要的經濟和營養價值，現代八倍體栽培草莓起源于兩個八倍體野生種弗州草莓和智利草莓的種間雜交。近日，中國科學院昆明植物研究所研究員朱安丹專題組深入解析了八倍體草莓的起源和遺傳分化特征。相關研究成果在線發表于《自然-植物》。朱安丹表示，由于草莓屬系統發育解析涉及未知的祖先、同源染色體交換和不完全
新研究解析栽培草莓“祖先”基因組圖譜
草莓具有重要的經濟價值和營養價值，現代八倍體栽培草莓起源于兩個八倍體野生種——弗州草莓和智利草莓的種間雜交。近日，中國科學院昆明植物研究所研究員朱安丹課題組深入解析了八倍體草莓的起源和遺傳分化特征。相關成果在線發表于《自然-植物》。 朱安丹表示，由于草莓屬系統發育解析涉及未知的祖先、同源染色體
科學家搭建草莓基因組數據庫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓為薔薇科草莓屬，因芳香多汁、營養豐富受到喜愛，在全國各地均可種植。栽培草莓為異源多倍體，基因組復雜，雜合度高。 2019年，《自然—遺傳學》發表了利用三代測序數據組裝的高
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
幾近完整的高質量草莓參照基因組公布
據英國《自然·遺傳學》雜志25日在線發表的一項研究，美國科學家報告了一個幾近完整的草莓參照基因組。該高質量基因組不但為了解草莓起源和演化歷史提供了新見解，還對未來改善其品種及提高抗病性大有助力。 八倍體栽培種草莓卡姆羅莎有8組染色體，也被稱為花園草莓，因其味美清香而深受喜愛。 此次，美國密歇
草莓基因組研究取得成果－|《自然遺傳學》
《自然-遺傳學》本周在線發表的一篇論文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome報告了一個幾近完整的草莓參照基因組。該基因組為了解這一廣受歡迎的水果的起源和演化歷史提供了新見解。八倍體草莓的演化史。Edger et al. 八
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
關于全基因組測序的測序指標介紹
一、全基因組測序的測序指標— 深度 測序深度（Sequencing depth）是指測序得到的堿基總量（bp）與基因組大小的比值，它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系，測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體，如果采用的是雙末端或Ma
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代，其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1，科學家通過454全基因組測序，掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因，包括抗病能力、牛奶產量，這些性狀已通過北美的當
我國完成小麥A基因組測序
本報訊（記者丁佳）5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和
我國完成小麥A基因組測序
?? 5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征，對深入和
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來，人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開，分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中，他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法"，人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法"，其實是一種
盤點最新基因組測序成果
the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者： 種屬：非洲腔棘魚（Latimeria chalumnae） 基因組：~2.86 billion bp 人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕，直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年
基因組測序的具體過程
講起來很復雜哈，簡單來說，就是邊合成邊測序，把所要測序的序列通過各種手段來建庫，然后加上5‘和3’都加上接頭，放在一個小玻璃片一樣的芯片上，上面一般是8個lane，把樣品加入到lane上之后和上面長好的接頭序列相結合（之前的建庫時加的接頭與之反向互補），然后再經過PCR擴增的過程形成一個DNA簇，然
簡化基因組測序好做嗎
簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度，進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD（Restriction site Associated DNA）和GBS（Genotyping By Sequencing）。這些技
白肉靈芝完成基因組測序
?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日，中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉，這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3：基因，基因組，遺傳學》（G3-Genes Genomes Genet
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基
中國蓮基因組測序完成
繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后，近日，中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作，順利完成中國蓮的基因組測序，構建了首張中國蓮全基因組圖譜，相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。 “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎，也標志著我國相關研究將對生物進
讓基因組測序繞過PCR
?在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-
Nature完成桉樹基因組測序
一個橫跨五大洲的科學團隊宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成，巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。 巨桉生長速度快，可以用作燃料和木材，是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東
測序解讀基因組，真的好嗎？
測序解讀基因組，真的好嗎？ “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire，在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說，“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年，但