昆明動物所等在蝴蝶基因組研究中取得進展
蝴蝶因其在自然界中多姿多彩的變異,自達爾文時期以來就是進化研究的好材料。然而,長期以來其高雜合的基因組難以解析,對其也缺乏有效的遺傳操作技術體系,極大地限制了蝴蝶在進化學研究的深入廣泛應用。 為了使蝴蝶成為研究宏觀形態進化遺傳基礎的新模式生物,中國科學院昆明動物研究所的基因起源課題組與深圳華大基因研究院和美國芝加哥大學等單位合作,利用雜合組裝的方法攻克了高雜合基因組難以組裝的難題,獲得了柑橘鳳蝶(Papilio xuthus)和金鳳蝶(Papilio machaon)兩個近緣種的高質量參考基因組。結合比較基因組學和轉錄組學分析發現了一些在蝴蝶適應進化和分化中可能起著重要作用的基因。 在成功解析基因組的基礎上,他們利用CRISPR/Cas9基因編輯技術,以三個與形態有關的基因Abdominal-B、ebony和frizzled作為案例,首次在蝴蝶中成功實現了CRISPR/Cas9的基因編輯,觀察到了各基因的形態突變體。該研......閱讀全文
北京基因組研究所Plant-cell基因組研究新成果
來自中科院北京基因組研究所、荷蘭瓦赫寧根大學和中科院/馬普學會等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組,通過測序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因組提供了關于十字花科植物繁殖性狀和基因組進化的新認識。相關研究發表在植物學權威期刊The Plant Cell雜志上
GenomeResearch發表基因組研究新發現基因組
多倫多大學的科學家們發現,作為基因組看門人的C2H2-鋅指蛋白(C2H2-ZF)實際上肩負著更加多樣化的職責。這項發表在Genome Research雜志上的研究,有助于我們更準確地解讀個人基因組。C2H2-ZF有大約七百個成員,是規模最大的一種人類蛋白。然而,人們對這些蛋白一直知之甚少。C2H2-
The-Scientist:最熱門基因組研究
The Scientist雜志是由科學信息研究所(ISI,現為湯姆森路透科技集團)的創始人Eugene Garfield于1986年創辦的一份雙周刊報紙,后又轉變為一本每月出版的雜志,同時伴有每日更新的在線新聞。主要刊登生命科學相關信息,并幫助科學家分析研究的,以協助決策影響他們的
進擊的古基因組研究
? 今年5月,《科學》在線發表了一項中國科學院古脊椎動物與古人類研究所(以下簡稱古脊椎所)領銜的關于華夏族群探源的突破性研究成果,它揭開了有關中國南北方史前人群格局及遷移與混合這一重大學術問題上的若干謎團;兩個月后,該團隊又發布最新發現:通過古基因組研究最新發現距今約1.1萬年的中國南方未知現代人群
The-Scientist:最熱門基因組研究
The Scientist雜志是由科學信息研究所(ISI,現為湯姆森路透科技集團)的創始人Eugene Garfield于1986年創辦的一份雙周刊報紙,后又轉變為一本每月出版的雜志,同時伴有每日更新的在線新聞。主要刊登生命科學相關信息,并幫助科學家分析研究的,以協助決策影響他們的工作生活。
Nature發布基因組研究指南
測序人類全基因組比以往任何時候變得更快速、更便宜,使得比較患者與無特定疾病人群基因組一類的研究激增。臨床醫生和從事某種疾病遺傳貢獻研究的研究人員往往會遇到一些似乎與疾病相關的變異,但卻發現另外一些攜帶相同突變的人群并不罹患這種疾病或影響程度較輕。 醫生要怎樣找到真正引起疾病的遺傳變化?發表
CRISPR大規模基因組研究
來自杜克大學的研究人員設計出了一種能快速,方便有效靶向人類基因組任何基因的新方法,這種新工具建立在一種來自細菌的RNA引導酶的基礎上,即CRISPR-Cas RNA引導性核酸酶(RNA-guided nucleases,RGNs)。 這一研究成果公布在7月25日Nature Met
The-Scientist:最熱門基因組研究
The Scientist雜志是由科學信息研究所(ISI,現為湯姆森路透科技集團)的創始人Eugene Garfield于1986年創辦的一份雙周刊報紙,后又轉變為一本每月出版的雜志,同時伴有每日更新的在線新聞。主要刊登生命科學相關信息,并幫助科學家分析研究的,以協助決策影響他們的工作生活。
《基因組研究》:首張貓基因組草圖繪就
貓是研究人類失明和艾滋病模型之一,因此測序結果大有用處 一只名為“肉桂”(Cinnamon)的4歲雌性阿比西尼亞貓有幸成為第一只完成基因組測序草圖的貓。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在內的基因組“俱樂部”。相關論文11月1日在線發表于《基因組研究》(Genome Research)雜
基因組所人類基因組突變研究獲進展
序列變異的周期性和與TCR相關聯的突變 基因突變會導致人類疾病的產生,因此研究遺傳變異的產生過程和那些能夠引起疾病的突變對生命科學基礎研究以及人類健康是十分關鍵和重要的。 近日,中國科學院北京基因組研究所于軍研究員帶領其研究團隊,在有關人類基因組中以轉錄為中心的突變研究方面取得新進展
Science發表基因組研究重要成果
科學家們日前發現,人類基因組的遺傳學差異主要來自于拷貝數變異(CNV)。在此之前人們對CNV的了解并不多,因為CNV一直是基因組測序的一大挑戰。 華盛頓大學的遺傳學家Evan Eichler領導研究團隊克服了這一困難。他們對來自全球125個族群的人進行了深度基因組測序,全面分析了基因組中的SN
Science發表基因組研究重要成果
科學家們日前發現,人類基因組的遺傳學差異主要來自于拷貝數變異(CNV)。在此之前人們對CNV的了解并不多,因為CNV一直是基因組測序的一大挑戰。 華盛頓大學的遺傳學家Evan Eichler領導研究團隊克服了這一困難。他們對來自全球125個族群的人進行了深度基因組測序,全面分析了基因組中的SN
中藥基因組工程研究項目啟動
??? 7月上旬,中藥基因組工程科技大廈選址于長沙岳麓山大學城湘江風光帶北端,與此配套的中藥材基因庫已在岳麓區觀砂嶺茶子山村動工建設,規劃占地200畝,擬建成一個符合國際標準的中藥材種植試驗基地和湖南省珍稀植物藥種資源保護與繁殖基地。這標志著中藥基因組工程研究項目正式啟動。? ??? 我省中醫藥
大型基因組研究揭示失眠機理
日前,對人類基因組進行的兩項深入研究揭示,經常被歸咎于壓力或不良睡眠習慣的失眠癥,可能與抑郁癥、心臟病以及其他生理疾病的關系更加密切。 “這兩項研究都做得非常出色。”美國賓夕法尼亞大學佩雷爾曼醫學院研究睡眠行為的心理學家Philip Gehrman表示。但是他強調,在將與失眠有關的基因聯系轉化
大型基因組研究揭示失眠機理
圖片來源:DIMABERLIN 本報訊 日前,對人類基因組進行的兩項深入研究揭示,經常被歸咎于壓力或不良睡眠習慣的失眠癥,可能與抑郁癥、心臟病以及其他生理疾病的關系更加密切。 “這兩項研究都做得非常出色。”美國賓夕法尼亞大學佩雷爾曼醫學院研究睡眠行為的心理學家Philip Gehrman表示。但
Nature發布基因組研究重要成果
如果歌手Paul Simon給Richard Lenski長期進化實驗(LTEE)中的細菌寫首歌,那歌名可以是“這么多年以后仍然在改變。” 發表在8月1日《自然》(Nature)雜志上的研究論文中,這位密歇根州立大學的著名微生物學和分子遺傳學教授與一個國際研究小組,利用先進的技術研究了數萬代的
TheScientist:值得關注的基因組研究
美國的《The Scientist》雜志是一本面向生命科學的學生、研究人員的雜志,與學術期刊不同的是,該雜志除了報道研究領域內的熱點話題外,還深入研究人員所關心的其他話題,如怎樣進行職業規劃、怎樣用高科技創業等。其背后有全世界最優秀的專家團隊――F1000(Faculty1000)的支持。近
Nature最新基因組研究成果
無論是接收禮物的圣誕襪,還是櫥窗里的漂亮衣服,棉花的作用滲透在即將到來的這個節日的方方面面中,然而對于生物能源研究人員來說,棉花纖維成分比其顏色和質地更為重要。 由來自31個研究機構組成的一個國際研究小組近期完成了基因組最簡單的棉花品種:Gossypium raimondii的詳細圖譜
利用CRISPR研究基因組“暗物質”
超過98%的人類基因組由非編碼基因組成。這些非編碼基因被稱為基因組的“暗物質”,它們能調控編碼基因的表達,從而影響人類健康和疾病進程。自從人類基因組序列被公開發表以來,科學家們努力解析基因中的功能元件,包括非編碼調節區——參與轉錄調節的順式調節區和非編碼RNA(ncRNA)。轉錄因子在整個基因組
全基因組研究解碼口吃根源
口吃跨越不同語言和血統,影響著全球約7000萬人。過去,許多人認為口吃能夠通過自主控制來改善。但數十年來的研究表明,口吃實際上是一種高度遺傳的不可控疾病,其原因復雜且模糊。而一項7月28日發表于《自然-遺傳學》上的研究讓口吃的部分原因變得清晰。 研究人員利用基因檢測服務公司23andMe的龐大
基因組所肝癌全基因組合作研究取得新進展
近日,由中國科學院北京基因組研究所所長吳仲義及其科學團隊與國立臺灣大學醫學院陳定信院士、陳培哲院士共同合作開展的“肝癌癌癥基因組合作研究”計劃獲最新進展,相關學術論文在在最新出版的PNAS雜志上發表。 “肝癌癌癥基因組合作研究”計劃于2009啟動,作為基因組所一項長期的癌癥基因
宏基因組研究新突破,復旦最新研究發Nature
近年來偽狂犬、猴痘等病毒從動物向人類外溢引發新發傳染病甚至全球大流行的頻率正在顯著增加如何精準預測和預報動物源新發傳染病是關系綠色健康養殖與公共衛生防控的重要科學問題復旦大學公共衛生學院粟碩教授團隊與合作者運用前沿交叉研究方法揭示多種哺乳動物宏基因組數據中的病毒基因組組成、生態學特征與跨物種傳播規律
研究發現人類合子基因組激活起始于父源基因組
表觀遺傳修飾包括DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質可及性和染色質高級結構等,在基因的表達調控中發揮重要作用。人類精子和卵細胞的染色質表觀修飾狀態存在較大差異。在受精后的早期胚胎里,來自精子的父源染色質和來自卵細胞的母源染色質會經歷劇烈的表觀遺傳修飾重編程,最終達到兩者類似的模式。人類胚胎的合子基因
基因組所發布表觀基因組關聯研究開放平臺EWAS-Open-Platform
近日,由中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)國家基因組科學數據中心(NGDC)開發的表觀基因組關聯研究資源開放平臺EWAS Open Platform上線。相關研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
茄子基因組研究邁入高清時代
10月31日,由廣西農業科學院蔬菜研究所研究員王益奎領銜的研究團隊,于生物學論文預印本服務器BioRxiv在線發布了染色體級別的高質量茄子基因組序列。該團隊采用PacBio測序技術,結合Dovetail Hi-C建庫技術與HiRise組裝算法,獲得了目前連續性最好的茄科作物基因組,標志著茄子基因
基因組研究持續存在“歐洲偏向”
科學家近日在《自然》雜志評論版塊撰文表示,目前基因組學持續存在一種“歐洲偏向”,即大部分研究以歐洲群體為主,這導致其多樣性嚴重不足。而正是歷史、文化、科學和情理因素交織在一起,使基因組學研究維持了這種“尷尬的偏向”。 全基因組關聯研究(GWAS)掃描成千上萬人的基因組,通過對大規模的群體D
最大規模腎癌基因組研究
腎癌起源于腎小管上皮細胞,是泌尿系統常見惡性腫瘤之一,發病率占全身惡性腫瘤的3%。腎癌的化療效果并不理想,腎切除手術被認為是最有效果的治療途徑。近50年來腎癌的發病率和死亡率在持續上升,但人們還不太清楚腎癌的發病原因。 貝勒醫學院的副教授Dr. Chad Creighton領導研究團隊深入分析
研究發現全新全基因組組裝方法
十年前,Illumina基因組測序技術進入市場時,前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今,第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 英國時間12月9日,《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 這篇論文只有兩位作者,
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
藍藻和葉綠體基因組的比較研究原核的藍藻和真核植物(包括其他藻類)中的葉綠體,都同樣進行放氧的光合作用,這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析,證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模
基因組學:-跨越癌癥研究國界
1982年11月,在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官,突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時,當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡,這讓我感到震驚,從那時開始我意識到,我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol