測序污染有多危險，如何防范與去除[實驗手冊]
一些研究表明，目前已經公布的基因組存在多種污染，隨著這個問題越來越突出，我們需要找出方法來應對 生物通報道：Supratim Mukherjee在進行數據分析的時候，發現數以百計的微生物基因組中會重復出現同一種噬菌體序列，這令他感到很驚訝。這位來自勞倫斯伯克利國家實驗室的生物信息學家最開始是為了比對這些微生物的代謝途徑，但后來他發現了幾乎無處不在的序列，“我以為我們發現了一些新的東西，”他回憶道，“在這些不同的微生物中，這整個噬菌體基因組是完整地保留下來的。” 但當Mukherjee一開始分析這個噬菌體序列時，他就知道這就是 PhiX 序列，一種Illumina公司測序試劑盒中用做標準品的噬菌體。PhiX 本來是作為一種質控檢測指標，用于追蹤每個測序過程中出現的錯誤率的，但在上百個案例中，Mukherjee發現研究人員都沒有從其公布的基因組序列中剔除Phi X的序列。 并不是只有Mukherjee一人發現此種情況，最近......閱讀全文
測序過程中出現“流氓基因”污染
Supratim Mukherjee在進行數據分析的時候，發現數以百計的微生物基因組中會重復出現同一種噬菌體序列，這令他感到很驚訝。這位來自勞倫斯伯克利國家實驗室的生物信息學家最開始是為了比對這些微生物的代謝途徑，但后來他發現了幾乎無處不在的序列，“我以為我們發現了一些新的東西，”他回憶道，“在
烏魯木齊多個監測站出現重度污染及嚴重污染
圖為在烏魯木齊城南拍攝的隱藏在薄霧之中的城市。 據烏魯木齊市環境保護局網站空氣質量實時報消息，2013年11月12日16時，烏魯木齊市區多個監測站出現重度污染及嚴重污染，其中七十四中學、鐵路局、新疆農科院農場等監測站為嚴重污染。
基因污染簡介
基因重組是不同基因通過酶促催化而產生轉移、交換而重新組合的過程，能使生物表達出新的結構和功能特征。如果基因重組生物從實驗室里擴散到自然界中，生物的新功能就有可能破壞生態平衡，從而產生基因污染。在掌握了嫁接、雜交方法改造生命的手段后，人類進一步學會了應用基因技術改造生命。基因工程的飛速發展，不但為人類
如何防止細胞培養出現污染
防止細胞培養出現污染的方法如下：1、從培養箱取放細胞前，用酒精清潔雙手（或手套），盡量縮短開門時間和減少開門次數。培養瓶放入培養箱前，用酒精消毒表面，并稍等至酒精揮發后再放入，以免培養箱內滯留過多乙醇蒸氣。2、操作的時候防護服、口罩、手套缺一不可。操作前，準備好所有實驗所需物品，以減少走動，物品需有
如何防止細胞培養出現污染
防止細胞培養出現污染的方法如下：1、從培養箱取放細胞前，用酒精清潔雙手（或手套），盡量縮短開門時間和減少開門次數。培養瓶放入培養箱前，用酒精消毒表面，并稍等至酒精揮發后再放入，以免培養箱內滯留過多乙醇蒸氣。2、操作的時候防護服、口罩、手套缺一不可。操作前，準備好所有實驗所需物品，以減少走動，物品需有
海南農業廳：尚未發現農業轉基因生物污染
近日，“海南發現濫種轉基因”引發輿論熱議。3月30日，海南省農業廳就轉基因執法檢查有關情況進行了通報，但一些媒體和網民對相關通報再次提出質疑。4月1日，海南省農業廳相關負責人就相關法律依據、執法檢查法律程序、執法信息發布等問題回答了記者提問。 問：為何海南省農業廳去年12月即開展執法檢查，
生物污染與化學污染、物理污染的區別
生物污染與化學污染、物理污染的不同之處在于：生物是活的、有生命的，外來生物能夠逐步適應新環境，不斷增殖并占據優勢，從而危及本地物種的安全。
微生物污染的污染途徑
微生物污染常見的是空氣的微生物污染和水的微生物污染。空氣雖然不是微生物產生和生長的自然環境,沒有細菌和其他形式的微生物生長所需要的足夠的水分和可利用的養料, 但由于人們的生產和生活活動使空氣中可能存在某些微生物, 包括一些病原微生物如結核桿菌、白喉桿菌、金葡菌、流感病毒、麻疹病毒等,可成為空氣傳播疾
生物污染的主要污染因子介紹
霉菌霉菌是一種能夠在溫暖和潮濕環境中迅速繁殖的微生物，其中一些能夠引起惡心、嘔吐、腹痛等癥狀，嚴重的會導致呼吸道及腸道疾病，如哮喘、痢疾等。患者會因此精神萎靡不振，嚴重時則出現昏迷、血壓下降等癥狀。塵螨塵螨是最常見的空氣微小生物之一，是一種很小的節肢動物，肉眼是不易發現的。塵螨是引起過敏性疾病的罪魁
京津冀中部可能出現中度污染過程
3月15日，中國環境監測總站聯合中央氣象臺、全國六大區域空氣質量預測預報中心和北京市環境保護監測中心，開展3月中下旬全國空氣質量預報會商。3月中下旬，我國南方地區空氣質量以優良為主，華東內陸、華南兩廣和西南四川盆地可能出現輕度污染；北方地區大部以良至輕度污染為主，17日-19日京津冀中部可能出現
北京本周可能出現兩次重污染
記者日前從北京市環保局了解到，本周（11月24日~30日），北京可能出現兩次空氣重污染過程。北京市有關部門已加大監管、執法力度，嚴格控制燃煤、機動車、工業及揚塵污染排放，同時號召全體市民堅持綠色生產、生活方式，共同減緩空氣污染程度。 據北京市環境保護監測中心主任張大偉介紹，預計11月24日~3
測序過程中出現的污染來自哪里？
Supratim Mukherjee在進行數據分析的時候，發現數以百計的微生物基因組中會重復出現同一種噬菌體序列，這令他感到很驚訝。并不是只有Mukherjee一 人發現此種情況，最近大量的報告表明，發表的基因組出現污染要比之前想象的多得多。那么這些污染是如何出現的呢？我們又能做些什么，避免這些
什么是生物污染？
對人和生物有害的微生物、寄生蟲等病原體和變應原等污染水、氣、土壤和食品，影響生物產量，危害人類健康，這種污染稱為生物污染。
生物污染的特點
一是預測難，人們對外來生物在什么時候、什么地方入侵難以作出預測。二是潛伏期長，一種外來生物侵入之后，其潛伏期長達數年，甚至數十年，因此，難以被發現，難以跟蹤觀察。三是破壞性大，外來生物的侵入，在破壞了當地生態環境的同時，也破壞了該生態系統中各類生物的相互依存關系，可能造成嚴重的后果。
生物污染的特點
一是預測難，人們對外來生物在什么時候、什么地方入侵難以作出預測。二是潛伏期長，一種外來生物侵入之后，其潛伏期長達數年，甚至數十年，因此，難以被發現，難以跟蹤觀察。三是破壞性大，外來生物的侵入，在破壞了當地生態環境的同時，也破壞了該生態系統中各類生物的相互依存關系，可能造成嚴重的后果。
生物污染的種類
高山、大海、沙漠、河流等的天然屏障作用，使得不同的區域形成了形態各異的生態系統。生物污染是指外來生物被有意無意地引入一個新的生態系統內，并對該系統造成影響或危害的現象。生物污染按照物種的不同，可以分為：動物污染（主要為有害昆蟲、寄生蟲、原生動物、水生動物等）植物污染（雜草是最常見的污染物種，還有某些
基因污染的概念
基因污染(Genetic pollution)指對原生物種基因庫非預期或不受控制的基因流動。?外源基因通過轉基因作物或家養動物擴散到其他栽培作物或自然野生物種并成為后者基因的一部分，在環境生物學中我們稱為基因污染。基因污染主要是由基因重組引起的。
我國東北地區出現空氣重污染過程
環境保護部今日（9日）向媒體通報，11月6日起，受不利氣象條件和污染排放的影響，我國東北地區持續出現空氣重污染過程。 環境保護部環境監測司司長羅毅介紹說，11月6日，全國338個城市中，10個城市空氣質量出現重度及以上污染，均位于東北地區。其中哈爾濱、長春、吉林和四平為嚴重污染，綏化、遼源、七
FID出現污染時，應采取的預防措施
FID是氫火焰離子化檢測器的簡稱，屬于質量型檢測器，主要包括一個不銹鋼制成的離子室、氣體入口、火焰噴嘴、發射極和收集極、點火線圈、外罩等部件。??? 因為噴嘴所處位置極易被污染。一旦檢測器被污染，輕則靈敏度明顯降低或噪聲增大，基線不穩，重則會熄火或點不著火，嚴重影響氣相色譜的定性和定量分析，那么當出
指示生物污染物測定方法介紹水污染指示生物
水污染指示生物是指在一定的水體范圍內，能通過其特性、數量、種類或群落等變化，對水體中的污染物產生各種定性、定量指示作用的生物。水污染指示生物主要有浮游生物、著生生物、底棲生物、魚類和微生物等。（1）浮游生物? 浮游生物就是懸浮生長在水體中的生物，包括浮游植物和浮游動物兩類。它們大多數個體很小，游動能
科學家闡明有機污染修復中微生物功能基因作用
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2017/9/387933.shtm
基因不同可致體檢出現偏差
日本東京大學和理研究所的研究小組對日本人遺傳基因解析時，發現了46個可以左右健康體檢等血液檢查結果的遺傳基因。這是研究小組用計算機從全日本20萬人的DNA和血液中，對遺傳基因個人差異、20項血液檢查數據、遺傳基因數據、實際身體健康狀況等進行后得出的結論。由于個體不同、遺傳基因類型不同，個體差別也不相
基因不同可致體檢出現偏差
《自然—遺傳學》：基因不同可致體檢出現偏差 發現46個可左右健康體檢等血液檢查結果的遺傳基因 日本東京大學和理化學研究所的研究小組對日本人遺傳基因解析時，發現了46個可以左右健康體檢等血液檢查結果的遺傳基因。這是研究小組用計算機從全日本20萬人的DNA和血液中，對遺傳基因個人差異、2
生物污染的主要種類
生物污染按照物種的不同，可以分為：動物污染（主要為有害昆蟲、寄生蟲、原生動物、水生動物等）植物污染（雜草是最常見的污染物種，還有某些樹種和海藻等）微生物污染（包括病毒、細菌、真菌等）。
消除微生物污染
實驗方法原理通過沖洗單層培養物或通過離心重懸非貼壁細胞，以高濃度抗生素清洗培養物數次，然后將培養物傳代，用加抗生素的培養基傳三次，再用不加抗生素的培養基傳三次，每次傳代后都要檢測是否污染。實驗材料DBSS ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
消除微生物污染
實驗方法原理 通過沖洗單層培養物或通過離心重懸非貼壁細胞，以高濃度抗生素清洗培養物數次，然后將培養物傳代，用加抗生素的培養基傳三次，再用不加抗生素的培養基傳三次，每次傳代后都要檢測是否污染。實驗材料 DBSS試劑、試劑盒 高濃度抗生素培養液儀器、耗材 用于傳代培養的材料帶有40×或60×物鏡的相差顯
消除微生物污染
實驗方法原理通過沖洗單層培養物或通過離心重懸非貼壁細胞，以高濃度抗生素清洗培養物數次，然后將培養物傳代，用加抗生素的培養基傳三次，再用不加抗生素的培養基傳三次，每次傳代后都要檢測是否污染。實驗材料DBSS試劑、試劑盒高濃度抗生素培養液儀器、耗材用于傳代培養的材料帶有40×或60×物鏡的相差顯微鏡用于
生物污染的主要途徑
原料污染食品原料在采集和加工前期，表面上往往附著很多細菌，特別是表面破損的水果、蔬菜、肉類和水產品。烹調用具和餐具污染加工污染加工食品多是包裝食品，一般較為清潔，但也會受到二次污染。當廚房衛生條件不良時，空氣中漂浮的細菌會沉降到食品表面；在烹調加工過程中，如果不注意生熟分開，細菌就會從生鮮食品或半成
進口轉基因大豆將帶來“基因污染”
今年頭兩個月，黑龍江省大豆進口量激增，達到26.9萬噸，同比增長6563.5%。而黑龍江省的大豆出口呈相反態勢，今年頭兩個月僅出口1879噸，同比下降92.2%。 “一旦進口的轉基因大豆占領黑龍江市場，危及的將不僅是當地世代以大豆種植為生的農戶的利益和生存，黑龍江大豆的原產種源、環境也將遭
微生物污染的概念和污染來源
微生物污染是指由細菌與細菌毒素、霉菌與霉菌毒素和病毒造成的動物性食品生物性污染。微生物污染包括細菌性污染、病毒和真菌及其毒素的污染。據世界衛生組織估計,在全世界每年數以億計的食源性疾病患者中,70%是由于食用了各種致病性微生物污染的食品和飲水造成的。微生物污染也是主要傳染性疾病的源頭。當前有20%的