上海應物所等在DNA計算方面取得進展
近日,中國科學院上海應用物理研究所物理生物學研究室與丹麥奧胡斯大學合作,在基于DNA納米結構的數學運算方面取得了新進展,建立了基于組合學原理的DNA計算器原型。相關結果發表在《自然·通訊》雜志上(Nature Communications, 2015, 6, 10089),該雜志同時發布了報道(Press release)。 DNA分子具有強大的序列可編程性及精確的分子識別能力,被認為是發展下一代生物計算機的理想材料。1994年,圖靈獎獲得者Leonard Adleman教授首次提出了DNA計算的思想,展示了DNA分子強大的平行計算能力。然而,現有的原型DNA計算機往往存在輸入輸出不一致、信號串擾、運算效率低等問題,并且缺乏直觀的輸出模式,其運算過程與結果往往難以解讀,限制了DNA計算領域的發展。 上海應物所柳華杰、樊春海等研究人員與Kurt Gothelf教授合作,提出了基于組合學原理建立類似“查找表”的全新DNA計算......閱讀全文
DNA計算機模型檢測神秘面紗揭開
?? DNA計算機的研制是各國競爭的一個科技制高點。17日,記者從鄭州大學信息工程學院獲悉,該校朱維軍副教授、周清雷教授開發出一系列算法,初步解決“DNA模型檢測”這一困擾國際DNA計算機學界多年的核心技術難題。 與其他計算工具相比,計算機的本質優點在于通用性,而通用性歸根結底在于千變萬化的具體
錯流超濾的計算模型
錯流超濾的計算模型錯流超濾的自由空間內流體對膜表面有剪切力的作用,其滲透率在管道長度方向是變化的。針對錯流超濾的特點,在膜的上層部分引入了流體自由流動空間,用方程來描述。在自由空間和膜的界面處,用流體的連續性將自由空間和膜介質的流場進行了耦合。膜的污染描述,基于死端超濾建立起來的污染模型。在錯流超濾
計算/DNA測序儀
測序反應精確度計算公式:100%-差異堿基數(不包括n數)/650×100%差異堿基即測定的dna序列與已知標準dna序列比較不同的堿基,n為儀器不能辨讀的堿基。
DNA測序儀的計算
測序反應精確度計算公式:100%-差異堿基數(不包括n數)/650×100% 差異堿基即測定的dna序列與已知標準dna序列比較不同的堿基,n為儀器不能辨讀的堿基。
DNA復制的計算規律
DNA復制的計算規律:每次復制的子代DNA中各有一條鏈是其上一代DNA分子中的,即有一半被保留。一個DNA分子復制n次則形成2n個DNA,但含有最初母鏈的DNA分子有2個,可形成2Ⅹ2n條脫氧核苷酸鏈,含有最初脫氧核苷酸鏈的有2條。子代DNA和親代DNA相同,假設x為所求脫氧核苷酸在母鏈的數量,形成
關于DNA雙螺旋的模型介紹
DNA分子雙螺旋結構積塑模型是一種采用優質彩色塑料原料制造的生物遺傳物質脫氧核糖核酸(DNA)分子的裝配式結構模型。本模型利用具有特殊形狀結構的紅、黃、藍、綠四種色球(分別代表A、T、G、C四種核苷)和棕棒(代表磷酸P)五種零件,不僅可裝配成具有雙螺旋空間結構的DNA分子鏈,而且還可以直觀地表達
大模型加速改變云計算行業規則
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498365.shtm
靜態摩擦性能計算模型領域取得突破
近日,中國科學院蘭州化學物理研究所潤滑材料全國重點實驗室的計算摩擦學課題組在靜態摩擦性能計算模型方面取得了重要進展。這項研究不僅加深了我們對摩擦現象的理解,還為未來摩擦學的發展奠定了堅實的基礎。相關論文發表于Physical Review B。 摩擦,這個在我們日常生活中無處不在的現象,其實蘊
玻璃固化配方設計及性能計算模型初步建成
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495080.shtm 滾燙的玻璃熔融體從熔爐中緩緩澆注進容器 冷卻凝固后的玻璃體整齊地放入庫房…… 莫非我們正身處某個玻璃生產廠之中嗎? 這些玻璃怎么不像平時見到的那樣晶瑩透亮呢?
Nature:計算機模型預測學術成功
電腦模型預測論文數量、任職機構及性別關乎學術成就 在發表同等數量文章的情況下,和男性生物學家相比,女性生物學家成為學術帶頭人的可能性更低。 最近,研究者用電腦模型證明:對事業起步期的科學家來說,“不發表就發臭”是一條黃金準則。根據計算公式,對于年輕科學家來說,以第一作者身份在知名期刊上發表的論文
計算機模型高估全球安全捕魚量
近些年來,針對過度捕撈問題,科學家和資源管理者絞盡了腦汁,通過估算魚類種群數量,制定各種政策措施,以在商業利益與生態健康和可持續性之間取得平衡。近日,一項發表于《科學》的研究對全球230個海洋漁場1980年至2018年的實際捕魚數據及計算機模型預測值進行分析后發現,計算機模型往往高估了魚類種群規模,
計算機模型解開塑料的“基因密碼”
人們的生活離不開塑料。但迄今為止,工業上還是先開發出一種塑料,然后才去發現它的用途,或試驗幾百種不同的“配置”看看哪種管用,既費時又費錢。據美國物理學家組織網9月30日(北京時間)報道,最近,英國利茲大學和杜倫大學解決了這一難題,他們開發出一種計算機模型,能在化學水平預測各種高分子成型時的形狀,
國家超級計算天津中心發布“天河天元”大模型
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/501029.shtm5月20日,在第七屆世界智能大會上,國家超級計算天津中心正式發布“天河E級智能計算開放創新平臺”和“天河天元大模型”。近期,ChatGPT的爆火引發了信息技術領域的“大模型熱”,國內多
交大Nature發文,DNA計算領域取得進展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508432.shtm上海交通大學化學化工學院/變革性分子前沿科學中心樊春海院士與王飛副教授近期發展了一種支持通用性數字計算的DNA可編程門陣列(DNA-based programmable gate ar
人工智能新模型可解碼DNA隱藏“語言”
DNA包含了維持生命所需的基礎信息。理解這些信息是如何存儲和組織的,一直是20世紀最大的科學挑戰之一。現在,借助GROVER這一基于人類DNA訓練的新型大型語言模型,研究人員有望解碼基因組中隱藏的復雜信息。GROVER由德國德累斯頓工業大學生物技術中心開發,它將人類DNA視為文本,通過學習其規則和上
人工智能新模型可解碼DNA隱藏“語言”
DNA包含了維持生命所需的基礎信息。理解這些信息是如何存儲和組織的,一直是20世紀最大的科學挑戰之一。現在,借助GROVER這一基于人類DNA訓練的新型大型語言模型,研究人員有望解碼基因組中隱藏的復雜信息。GROVER由德國德累斯頓工業大學生物技術中心開發,它將人類DNA視為文本,通過學習其規則和上
人工智能新模型可解碼DNA隱藏“語言”
DNA包含了維持生命所需的基礎信息。理解這些信息是如何存儲和組織的,一直是20世紀最大的科學挑戰之一。現在,借助GROVER這一基于人類DNA訓練的新型大型語言模型,研究人員有望解碼基因組中隱藏的復雜信息。GROVER由德國德累斯頓工業大學生物技術中心開發,它將人類DNA視為文本,通過學習其規則和上
人工智能新模型可解碼DNA隱藏“語言”
DNA包含了維持生命所需的基礎信息。理解這些信息是如何存儲和組織的,一直是20世紀最大的科學挑戰之一。現在,借助GROVER這一基于人類DNA訓練的新型大型語言模型,研究人員有望解碼基因組中隱藏的復雜信息。GROVER由德國德累斯頓工業大學生物技術中心開發,它將人類DNA視為文本,通過學習其規則
人工智能新模型可解碼DNA隱藏“語言”
科技日報北京8月6日電?(記者張佳欣)DNA包含了維持生命所需的基礎信息。理解這些信息是如何存儲和組織的,一直是20世紀最大的科學挑戰之一。現在,借助GROVER這一基于人類DNA訓練的新型大型語言模型,研究人員有望解碼基因組中隱藏的復雜信息。GROVER由德國德累斯頓工業大學生物技術中心開發,它將
港中大研發精準計算模型預測病毒基因演變
香港中文大學(港中大)2日公布,港中大醫學院研究團隊建立了一套精準計算模型“beth-1”,能準確預測病毒基因演變,有助在設計流感疫苗時選擇最具代表性的病毒株。港中大醫學院表示,流感病毒會持續出現基因進化演變,導致免疫逃脫,令已經感染過病毒或打過疫苗的人可能再次感染突變后的病毒,造成新的季節性流感高
神經元新計算模型或產生更強大AI
模型或產生更強大AI?數字手與人手相互繪制圖畫(藝術圖)。圖片來源:西蒙斯基金會科技日報北京6月30日電?(記者張夢然)幾乎所有支持現代人工智能(AI)工具的神經網絡都是基于20世紀60年代的活體神經元計算模型。但美國西蒙斯基金會熨斗研究所計算神經科學中心(CCN)開發的新模型表明,這種已有數十年歷
研究提出鋰循環可計算一般均衡模型
在全球碳中和目標驅動下,鋰離子電池作為能源轉型核心技術,其全球化產業鏈隱藏著碳排放難題。供應鏈的地理分散導致碳排放分布不均,碳足跡核算與管控復雜,給全球協同減碳帶來嚴峻挑戰。 近日,中國科學院廣州能源研究所團隊聯合北京工業大學等單位,率先構建“鋰電池全生命周期可計算一般均衡(LCCGE)”模型
使用分光光度法檢測DNA純度和計算DNA含量
DNA在260nm處吸收強烈,OD260值為1的溶液相當于大約50μg/mL雙鏈DNA,而蛋白質的特征吸收在280nm處,測定DNA提取物中260nm處和280nm處的吸收值OD260和OD280,可大致判斷所提取的DNA的純度。OD260/OD280的值在1.7~1.9之間,說明提純度較好,低于1
科學家建立中國人群“免疫年齡”計算模型
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504754.shtm
美國新計算模型可捕捉化學反應過渡態
美國麻省理工學院科研團隊開發出一種基于機器學習的方法,可以更快的計算化學反應過程中的過渡態,幫助化學家設計新的化學反應和催化劑。 新計算方法使用“擴散模型”來表示兩種相對于彼此任意方向的反應物,該模型可以了解哪種類型的過程最有可能產生特定的結果。科研人員在大約1,000個以前從未見過的反應上測
3D計算機模型揭開舌頭的奧秘
新3D模型展示出舌頭上復雜交織的肌肉。 無論何時說話或者吞咽,我們都會用到舌頭。然而,關于舌頭如何活動的很多問題仍然是個謎。現在,研究人員創造了一個人類舌頭的3D計算機模型,并可以通過它來揭開舌頭的秘密。 這個模型的創建是基于“人體可視化計劃”的數據,該計劃于20世紀90年代用大塊明膠對
全國首個DNA存儲領域預訓練大模型“ChatDNA”發布
近年來,DNA 和人工智能一直都是科技發展的熱門議題。隨著科學技術的進步,它們之間便有了無限的可能性。例如,DNA 和人工智能可以幫助我們更快地研究特定基因組的變異和功能。科學家可以使用人工智能算法來分析大量的 DNA 序列,從而發現有價值的變異和基因功能,為疾病的治療提供線索。DNA 是生物世界中
交大Nature發文,在DNA計算領域取得重要進展
上海交通大學化學化工學院/變革性分子前沿科學中心樊春海院士與王飛副教授近期發展了一種支持通用性數字計算的DNA可編程門陣列(DNA-based programmable gate array, DPGA),可通過分子指令編程的方式實現通用數字DNA計算,實現了無衰減大規模液相分子電路的構建。該成
計算機模型揭示猴子更適用于癡呆研究
俄羅斯研究人員發現用老鼠開展早老性癡呆治療研究所得出的某些結論,一旦用于人體就會出問題。為探究其中原委,俄研究人員研制出一種計算機模型,其分析結果顯示,這種病在老鼠和人體內的表達有很大差別,而猴子更適合用于研究這種疾病。 醫學界此前發現,大腦中貝塔淀粉樣蛋白大量積聚是導致早老性癡呆的直接原
上海藥物所發展出基于知識圖譜的計算模型
9月19日,中國科學院上海藥物研究所鄭明月課題組在《細胞-基因組學》(Cell Genomics)上,發表了題為Identifying compound-protein interactions with knowledge graph embedding of perturbation trans