基因組所半導體所研制的“模塊化DNA分析系統”通過驗收
4月1日，由中科院北京基因組研究所與中科院半導體研究所共同承擔的中科院重大科研裝備研制項目——“模塊化DNA分析系統”項目，通過專家組評審驗收。該項目的完成，標志著我國在第二代DNA測序儀研發方面，形成了具有自主知識產權的高通量DNA測序技術及其系統樣機，在高端生命科學儀器裝備國產化方面取得了突破性進展，填補了國內空白。 3月30日至4月1日期間，在中科院計劃財務局的組織協調下，由動物所魏輔文、趙建國研究員，生物物理所杭海英、蔣太交研究員，昆明植物所高立志、龍春林研究員，物理所魏志義研究員等眾多不同領域專家組成驗收組對該項目進行了全面詳實的測試和驗收考核。期內，驗收組認真聽取了由基因組所項目負責人于軍研究員、半導體所項目負責人俞育德研究員等人所作的項目研制工作、用戶使用、測試和經費決算報告，驗收組成員現場考察了研制的系統設備，并進行實際操作使用，審核了測試組提供的模塊化DNA分析系統數據產出情況。通過三天的評審及對各項指標......閱讀全文
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來，人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開，分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中，他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法"，人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法"，其實是一種
基因組所半導體所研制的“模塊化DNA分析系統”通過驗收
4月1日，由中科院北京基因組研究所與中科院半導體研究所共同承擔的中科院重大科研裝備研制項目——“模塊化DNA分析系統”項目，通過專家組評審驗收。該項目的完成，標志著我國在第二代DNA測序儀研發方面，形成了具有自主知識產權的高通量DNA測序技術及其系統樣機，在高端生命科學儀器裝備國產化方面取得了突
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
美用新技術完成炭疽基因組測序
美國喬治亞理工學院科學家使用一種稱為RNA測序的新技術，描繪出了炭疽芽孢桿菌的基因表達。公布在最新一期《細菌學》雜志網絡版上的此項研究成果，標志著任何細菌轉錄(細菌表達不同基因時產生的完整信使RNA集合)自此可被全面定義，并為研究細菌如何調控基因表達提供了更多細節。 喬治亞理工學院光
最新測序技術能用單個細胞分析基因組
美國物理學家組織網9月18日報道，最近，來自美國加利福尼亞大學圣地亞哥分校、克雷格·文特爾研究院和Illumina公司的科學家對現代基因測序算法進行了改良，只需從一個細菌細胞中提取的DNA（脫氧核糖核酸）就可組裝成接近完整的基因組，準確率達到90%，而傳統的測序方法至少需要10億個
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
Illumina宣布推出迷你測序儀和半導體測序計劃
Illumina公司今天在摩根大通保健大會（JP Morgan Healthcare conference）上宣布了兩款新的新一代測序平臺，一款靶向測序系統MiniSeq，以及另一款仍在開發中的半導體測序儀。 同時，Illumina的CEO Jay Flatley還宣布了一款新的基因分型芯片，
Nature子刊發布重磅測序技術：基因組和轉錄組平行測序
四月二十七日的Nature Methods雜志上發布了一項引人注目的測序技術，G&T-seq（Genome and Transcriptome Sequencing）。該技術能夠實現大規模的DNA和RNA平行測序，同時展現單個細胞的基因組序列和基因活性。 研究人員用G&T-seq對220個小鼠
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止？
近日，南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化（polyadenylation）的轉錄本在
長讀長測序技術：拯救基因組組裝項目
隨著高精度長讀長測序技術的出現，基因組難以組裝的狀態正在改變。《Nature Methods》雜志上近日發表了一篇文章，介紹了基因組組裝項目如何受益于這種技術。 自測序技術問世以來，利用DNA序列的片段來組裝人類、動植物或微生物的基因組就一直是難題。許多參考基因組都存在缺陷，如組裝錯誤或存在缺
我國自主研發的DNA測序儀BIGIS4產出首例科研成果
近日，由中國科學院科研裝備研制項目資助，中科院北京基因組研究所與中科院半導體研究所共同研發的，具有自主知識產權的國產化高通量DNA測序儀BIGIS-4系統日前投入試運行。 基因組所的科研人員應用該系統完成了海洋中溫菌（Glaciecola mesophila）的基因組測序工作，
半導體測序助力胎兒遺傳測試
? 來自中國廣州醫科大學等機構的科研人員報告了一種基于半導體的DNA測序平臺可能有助于增加胎兒遺傳測試的速度并減少成本。??? 近來基于大規模平行測序的方法已經促進了迅速的、非侵入式的出生前遺傳測試，這種測試通過分析母親血漿中流動的無細胞DNA從而測試被稱為非整倍性的染色體拷貝數的異常。???
半導體技術策動新一輪基因測序價格戰
從幾萬美元到幾千美元，完成個人全基因組測序所需要的花費越來越少，所需要的時間越來越短，并且，發生這樣加速度變化的頻率也越來越高。 今年3月份，總部位于美國加利福尼亞州的生命科學廠商Life Technologies公司又宣布在中國推出新的臺式基因測序儀 Ion Proton。借助該技
Life－Technologies推出Ion－PGM－首款半導體技術的測序儀
Life Technologies公司今日宣布推出Ion Personal Genome Machine（PGM?）測序儀，這是第一款使用半導體測序技術的產品。 這臺測序儀的制造商是Ion Torrent公司，幾個月之前，Life Technologies收購了該公司。Ion PGM測序儀的設
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
羅氏宣布推出目標基因組測序的新技術
羅氏應用科學部（Roche Applied Science）旗下的Roche NimbleGen公司的宣布推出商業化的NimbleGen序列捕獲技術（NimbleGen Sequence Capture technology），以幫助那些希望對基因組選定目標區域進行高通量測序的科學家們。這項新技術使
多種測序技術成就高質量的蚊子基因組
提起蚊子，相信大家沒有愛只有恨吧。這種惱人的生物不僅會吵得你睡不好覺，還會傳播多種疾病。每年全球大約有4億人感染由埃及伊蚊（Aedes aegypti）傳播的病毒，包括登革熱、黃熱病、寨卡和基孔肯雅病毒。 為了更好地了解蚊子背后的生物學，并開發消滅蚊子的工具，由洛克菲勒大學領導的國際研究團隊本
JAMA：全基因組測序用于臨床仍存在技術挑
據3月12日發表在《美國醫學會雜志》上的一則研究報告披露，在一項有12名成年人參與的探索性研究中，應用全基因組測序(WGS)與不完整的遺傳性疾病基因的覆蓋、檢測具有最高潛在臨床影響的基因變異的低復驗性，以及臨床報告發現的不確定性有關，盡管在某些案例中，WGS會發現基因變異株從而引入早期的醫療干預
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
二代測序的焦磷酸測序，合成法測序，連接法測序和離子半導體測序原理
不同的二代測序平臺的區別主要體現在測序反應的技術上，這些差別可以分為4類： 焦磷酸測序，合成法測序，連接法測序和離子半導體測序。焦磷酸測序 在焦磷酸測序中，測序反應通過每個核苷酸結合過程中釋放的焦磷酸來調控。釋放的焦磷酸參與了一系列化學反應從而導致鏈光的產生。發出的光由記錄基因蔟相應序列的相
年度創新：Ion－PGM半導體測序儀
【導讀】Rothberg博士的夢想是打造測序領域的“數碼相機”，既實惠又易用，還能快速得到結果。他確實做到了。與其他測序平臺相比，Ion PGM? 測序儀快速、簡捷，擴展性好，更關鍵的一點是，價格實惠。它讓測序平民化，讓每個實驗室都觸手可及。 半導體技術已經改變了它所觸及的每一個行業，從計算到攝影
測序技術發展過快？基因組學千萬大獎告吹
X獎基金會近日決定取消了獎金高達1000萬美元的基因組學Archon X獎(Archon Genomics X Prize)，因為基因組測序成本的直線下降已使得競爭毫無意義。 X獎基金會的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了關閉競賽的決定。他表示，這是因為如今
歐盟廉價快速DNA基因組測序與解碼技術獲得突破
歐盟第七研發框架計劃（FP7）提供220萬歐元資助，總研發投入290萬歐元，由歐盟6個成員國及聯系國塞爾維亞（總協調）、德國、英國、愛爾蘭、瑞士和以色列跨學科科研人員組成的歐洲NANODNASEQUANCING研發團隊。歷時3年多的研發創新活動終于修成正果，即廉價快速的DNA基因組測序與解碼技術
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代，其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1，科學家通過454全基因組測序，掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因，包括抗病能力、牛奶產量，這些性狀已通過北美的當
DNA測序的測序技術
高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（Next-generation sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等，主要有以
我國完成小麥A基因組測序
本報訊（記者丁佳）5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和
測序解讀基因組，真的好嗎？
測序解讀基因組，真的好嗎？ “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire，在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說，“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年，但