研究發展出新型三維基因組成像系統
4月7日，《細胞研究》發表了中國科學院生物物理研究所劉光慧課題組和徐濤課題組，以及中科院動物研究所曲靜課題組合作的題為Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究論文（封面故事）。該研究發展了一種新型三維基因組活細胞成像工具TTALE，并利用該系統實現了對端粒縮短和著絲粒構象變化等衰老伴隨的染色質結構改變的精準成像。此外，該研究發現了核仁區核糖體DNA拷貝數減少可以作為人類衰老的新型分子標志物。上述成果為在遺傳和表觀遺傳水平認識人類衰老的本質奠定了基礎。 近年來，CRISPR/Cas9和TALE等新型核酸結合蛋白的發現和廣泛應用使得對基因組特定序列的精準成像成為可能。然而，目前基于dCas9和TALE的成像系統尚存在一定的不足：dCas9系統的主要問題是由于其涉及多種蛋白和RNA元件，且dC......閱讀全文
DNA共有序列的結構特點
共有序列(consensus sequence) 決定啟動序列的轉錄活性大小。各種原核啟動序列特定區域內（通常在轉錄起始點上游-10及-35區域）存在共有序列（consensus sequence）
著絲粒DNA序列的概念
中文名稱著絲粒DNA序列英文名稱centromere DNA sequence定 義真核細胞染色體著絲粒部位可與動粒結合的DNA序列。應用學科細胞生物學（一級學科），細胞化學（二級學科）
T載體克隆的DNA序列分析
實驗目的： 了解常規DNA序列分析技術（Sanger雙脫氧法）的原理及操作步驟。 實驗原理： 在分子生物學研究中，DNA的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前用于測序的技術主要有Sanger等（1977）發明的雙脫氧鏈末端終止法和Maxam和Gilbert（1977）發明的化學
DNA序列多態性的定義
中文名稱DNA序列多態性英文名稱DNA sequence polymorphism定 義同一物種的不同基因組DNA等位序列之間的差異。包括長度多態、限制性酶切位點多態及單核苷酸多態等。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
Genome－Biology：食物會影響DNA序列
牛津大學的研究人員在兩種寄生蟲中檢測到了食物組分造成的DNA序列差異。他們在Genome Biology雜志上發表文章指出，食物能夠影響生物的基因序列。 “生物從食物中獲取原料構建自己的DNA。我們認為，食物組分可能應該能夠改變生物的DNA。我們也許可以預測素食者熊貓與肉食者北極熊之間的基因差
可銷毀特定DNA序列裝置出爐
英國《自然·通訊》雜志19日在線發表了一篇合成生物學論文，描述了一種基于“基因組編輯”CRISPR技術的的裝置，能銷毀轉基因生物中特定的DNA序列。控制住特定DNA序列銷毀的能力，其應用范圍將包括防止轉基因生物的環境釋放、幫助生物技術公司保護知識產權以及避免偷竊等等。 出于對轉基因微生物潛在
DNA保守序列的結構特點
保守序列（Conserved Sequence）：指在進化過程中基本保持不變的?DNA?分子中的一個核苷酸片段或者蛋白質中的氨基酸片段。
端粒DNA－序列的基本信息
端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是與端粒酶結合，完成染色體末端復制。端粒酶以其自身的RNA 為模板，在染色體端部添加上端粒的重復序列。作為模板的RNA 比較短，含有1.5 個端粒重復單元。端粒結構還能防止染色體融合及降解。?端粒是保護DNA分子中的基因
DNA序列和大規模DNA測序策略的探討（圖）
人類基因組計劃的核心內容之一是基因組測序。隨著人類基因組圖譜趨于完成，人類基因的 定位克隆、鑒定分析直至全基因組測序取得了突破性進展，測序策略的成熟、測序方法的改進、自動測序儀的廣泛應用、計算機數據分析系統的擴展以及測序分析能力的提高， 大大推進了大規模DNA測序的進程。第一節 DNA測序的基本方法
Science：CRISPR/Cas9大革命
??????? DNA編輯技術CRISPR近年來風生水起，已經開始取代了其它基因組編輯工具，如鋅指核酸酶和 TALENs等。不過目前科學家們對于這一技術中的RNA引導核酸內切酶：Cas9了解的還不夠多，如果能更精確的掌握這種酶在CRISPR系統中如何發揮作用的，將能提高這一技術的使用效率和
Cell－Res封面文章：新型三維基因組成像系統
來自中科院生物物理研究所，中科院動物研究所等處的研究人員發展了一種新型三維基因組活細胞成像工具TTALE，并利用該系統實現了對端粒縮短和著絲粒構象變化等衰老伴隨的染色質結構改變的精準成像。此外，該研究發現了核仁區核糖體DNA拷貝數減少可以作為人類衰老的新型分子標志物。上述成果為在遺傳和表觀遺傳水
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日，由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
新軟件按需組裝無縫基因組序列
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日報北京2月16日電?（記者張夢然）美國國立衛生研究院研究人員發布了一種創新的軟件工具，用于組裝來自各種物種的真正完整（即無縫）的基因組序列。這種名為Verkko的軟件在芬蘭
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明，白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該
胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出
來自美國的一個研究小組稱，他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序，繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱，這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程，對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜
－震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！
?震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！ 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低，全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源，但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用，使得基因組數據面臨很多問題。 近日，約翰霍
我學者觀測到人類基因組DNA上的“年輪”
1月31日，中科院生物物理研究所劉光慧課題組和徐濤課題組，以及中科院動物研究所曲靜課題組合作，研究發現了一種新型三維基因組活細胞成像工具，利用此工具實現了對衰老伴隨的端粒縮短和著絲粒異染色質改變的精準成像。更為有趣的是，該研究發現了核仁區核糖體DNA拷貝數的減少可以作為人類衰老的新型標志物,人類
細菌DNA序列可作信息“存儲器”
阿根廷科學家近日成功將該國國歌旋律以人工基因編碼形式植入某種細菌染色體中。這一方法不僅可以用來存儲音樂旋律，還可能發展為一種擁有巨大應用潛力的信息存儲方式。 據阿根廷媒體報道，主持研究的阿根廷信息生物學家費德里克·普拉達介紹說，生物的DNA(脫氧核糖核酸)由四種脫氧核苷酸組成，即腺嘌呤、胸
DNA堿基序列決定其光敏性
DNA分子在所有生命形態中扮演著遺傳信息載體的角色，對紫外光的修改具有高度的抵抗性，但要理解其光穩定性的機制還存在一些令人費解的問題，一個重要方面是構成DNA分子的4種堿基之間的相互作用。德國基爾大學的研究人員成功地證明，DNA鏈因其堿基序列而有不同的光敏感性。相關研究結果刊登在最近出版的《科學》（
細胞化學基礎著絲粒DNA序列
著絲粒DNA 序列(centromere DNA sequence,CEN)：著絲粒確保復制了的染色體能夠平均分配到子細胞中。它在間期及分裂期具有多種功能。著絲粒參與細胞周期的關卡調控并在間期能與核仁蛋白發生互作。著絲粒是動粒形成的位點，它位于染色體表面，在有絲分裂時結合微管并調控染色體運動。
雙脫氧鏈終止法測定DNA序列
[目的] 掌握雙脫氧鏈終止法測定DNA序列的原理與方法[原理]DNA聚合酶催化的DNA鏈延伸是在3’-OH末端上進行的。由于2’，3’-雙脫氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脫氧而失去游離-OH，當它參入到DNA鏈后，3’-OH末端消失，使DNA鏈的延伸終止。本實驗根據此原理，將待測DNA片段插
研究發展出新型三維基因組成像系統
4月7日，《細胞研究》發表了中國科學院生物物理研究所劉光慧課題組和徐濤課題組，以及中科院動物研究所曲靜課題組合作的題為Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究
研究發展出新型三維基因組成像系統
4月7日，《細胞研究》發表了中國科學院生物物理研究所劉光慧課題組和徐濤課題組，以及中科院動物研究所曲靜課題組合作的題為Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究
Science：有比CRISPRCas更安全的技術嗎？基于retroelement的基因組編輯工具
在一篇展望文章中，Stephen Tang和Samuel Sternberg討論了基于retroelement的基因編輯作為CRISPR-Cas方法的一種更安全的替代方法。 精確的基因組編輯技術改變了現代生物學。可編程DNA靶向的能力已經迅速提高，這主要是由于細菌RNA引導的CRISPR-Ca
草魚全基因組序列圖譜繪制完成
近日，記者從中國科學院水生生物研究所獲悉，該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成，相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據該所研究員汪亞平介紹，該研究采用鳥槍法測序策略，分別對一
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃（OGP）團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，
史上最全小麥基因組序列圖集問世
??據最新一期《自然》雜志報道，加拿大薩斯喀徹溫大學領導的國際團隊在一項對全球小麥生產具有里程碑意義的研究——10+基因組計劃中，對代表全球育種計劃的15個小麥品種的基因組進行了測序。這將使科學家和育種人員能夠更快地識別出具有影響力的基因，從而提高小麥產量、害蟲抗性和其他重要的農作物性狀。 小麥
四篇Science文章公布最新基因組序列
小麥是全球最重要的糧食作物之一，提供了20%人類所需的熱量。2010年英國科學家宣布他們繪制出了小麥基因組草圖，但這一序列并不完整。在7月17日Science雜志上，兩個研究組分別公布了Chinese Spring小麥品種的每個染色體臂的基因組序列，以及小麥染色體3B基因組序列，另外兩個研究小組
《Genome－Research》：根據基因組序列預測MRSA毒性
微生物毒力一直是一個復雜的多因素表型，與病原體的進化軌跡有著復雜的關聯。毒性，破壞宿主細胞膜和粘附的能力，粘附到人體組織的能力，是許多細菌病原體的主要毒力因子，包括金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黃色葡萄球菌是臨床上常見的毒性較強的細菌，自從上世紀40
中國新型冠狀病毒的基因組序列
《自然》雜志2月3日發表了新型冠狀病毒的基因組序列（論文：A new coronavirus associated with human respiratory disease in China），病毒樣本系從一名曾在最先爆發疫情的海鮮市場工作過的患者體內分離得到。基因組分析顯示，該病毒與此前在