研究發展出新型三維基因組成像系統
4月7日，《細胞研究》發表了中國科學院生物物理研究所劉光慧課題組和徐濤課題組，以及中科院動物研究所曲靜課題組合作的題為Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究論文（封面故事）。該研究發展了一種新型三維基因組活細胞成像工具TTALE，并利用該系統實現了對端粒縮短和著絲粒構象變化等衰老伴隨的染色質結構改變的精準成像。此外，該研究發現了核仁區核糖體DNA拷貝數減少可以作為人類衰老的新型分子標志物。上述成果為在遺傳和表觀遺傳水平認識人類衰老的本質奠定了基礎。 近年來，CRISPR/Cas9和TALE等新型核酸結合蛋白的發現和廣泛應用使得對基因組特定序列的精準成像成為可能。然而，目前基于dCas9和TALE的成像系統尚存在一定的不足：dCas9系統的主要問題是由于其涉及多種蛋白和RNA元件，且dC......閱讀全文
DNA和RNA靶序列的原位PCR擴增實驗
實驗材料 樣品試劑、試劑盒 雙氧水PBS蛋白酶KRNA酶DTTdNTPKClMgCl2Tris·Cl儀器、耗材 加濕盒熱循環儀實驗步驟 1. ?將載有固定樣品的載玻片置105℃加熱塊上5~120 s。?2. ?載玻片放入含0.3%H2O2中，于37℃或室溫溫育過夜，以滅活內源性過氧化物酶活性，然后以
DNA和RNA靶序列的原位PCR擴增實驗
原位PCR是Hasse等于1990年建立的技術，就是在組織細胞里進行PCR反應，它結合了具有細胞定位能力的原位雜交和高度特異敏感的PCR技術的優點，是細胞學科研與臨床診斷領域里的一項有較大潛力的新技術。實驗材料樣品試劑、試劑盒雙氧水PBS蛋白酶KRNA酶DTTdNTPKClMgCl2Tris·Cl儀
揭示重復序列對三維基因組區隔化的調控作用
Cell Research | 沈曉驊/孫育杰課題組合作揭示重復序列對三維基因組區隔化的調控作用 哺乳動物基因組DNA全長近2 m，經過多層有序組織與折疊后分布于直徑5-10 μm的細胞核中。染色質高級結構對基因表達，細胞分化和胚胎發育起著至關重要的作用。其中，基因組A/B區隔化（A/B c
DNA微序列技術
·?????????Protocols for Making Drosophila Arrays?(Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing,?
DNA－序列分析技術
試劑、試劑盒 瓊脂糖TE 水飽和酚無水乙醇70％乙醇TEMED測序酶溴化乙錠儀器、耗材 電泳儀離心管離心機冰浴箱恒溫板DNA 測序儀
DNA－序列分析技術
DNA序列分析技術可用于：（1）分析物種的遺傳多樣性；（2）鑒定新的物種；（3）用于比較基因組學。實驗方法原理本節描述運用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自動DNA 測序儀進行雙鏈DNA 測序的方法。熱循環測序反應使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe
DNA序列測定技術
DNA序列測定技術序列測定的技術和策略Sanger雙脫氧鏈終止法Maxam－Gilbert DNA化學降解法測序策略目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等（1977）提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭，但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的若干
DNA－序列分析技術
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本節描述運用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自動DNA 測序儀進行雙鏈DNA 測序的方法。熱循環測序反應使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator
DNA序列測定技術
DNA序列測定技術序列測定的技術和策略Sanger雙脫氧鏈終止法Maxam－Gilbert DNA化學降解法測序策略 目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等（1977）提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭，但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的
PCR擴增反應三部曲以及DNA（靶序列）的制備的步驟
?聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction PCR)是一種體外擴增特異性DNA片段的技術。它可以在體外特異地對目的基因進行大量擴增，其巧妙之處在預先設計合成二段分別與待測目的基因二端互補的引物，以起到指向定點的作用；再借助于DNA聚合酶催化的若干次擴增反應后，即可使特定的基
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定2
目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等（1977）提出的酶法（雙脫氧鏈終止法）和Maxam（1977）提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭，但這兩種方法都同樣生成相互獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸，每組核苷酸都有共同的起點，卻隨機終止于一種（或多種）特定的殘基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定3
2．利用末端轉移酶和α-32P-ddNTP標記DNA的3ˊ-末端 在二價陽離子存在下，末端轉移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羥基末端，如果作為底物的核苷酸經過修飾（如ddNTP），則可以在DNA的3ˊ-OH上僅加入一個核苷酸。對于雙鏈DNA片段，亦存在DNA的兩側均被標記問題，可通過上述同
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，選用合適的DNA聚合酶進行測序反應也是保證測序質量的重要因素之一。常用于雙脫氧末端終止法測序的有幾種不同的酶： 1．大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger測序的酶。但通常會有兩個問題：①Klenow片段的持續合成能力較
DNA序列分析技術2
3)電泳電極緩沖液 1 倍TBE（pH 值8.0）預電泳 30 分鐘至1 小時恒溫方式 測序膠板上夾蓋鋁恒溫板電泳溫度 50℃左右電泳條件 恒功率 90～110W電泳時間 2.5 小時至5 小時4)干膠制備和壓片電泳結束后取下膠板，用工具撬開玻璃板，使膠留在其中一塊板上。將裁剪好的新華3 號濾紙在膠
端粒DNA－序列的概念
端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是與端粒酶結合，完成染色體末端復制。端粒酶以其自身的RNA 為模板，在染色體端部添加上端粒的重復序列。作為模板的RNA 比較短，含有1.5 個端粒重復單元。端粒結構還能防止染色體融合及降解。端粒是保護DNA分子中的基因的
DNA序列家族的概念
中文名稱DNA序列家族英文名稱DNA sequence family;sequence family定 義DNA分子變性后可復性形成穩定的堿基配對雙鏈分子的一組序列。序列之間有很高的同源性。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
DNA自動序列測定試驗
[實驗原理]DNA 測序（DNA sequencing）是對DNA 分子的一級結構的分析。其基本原理是DNA 的復制反應體系中需要存在DNA 聚合酶、DNA 模板、寡核苷酸引物和dNTP，引物和模板退火形成雙鏈后，DNA 聚合酶在引物的引導下在模板鏈上沿3’→5’的方向移動，dNTP 按照堿
DNA序列分析技術1
物種的遺傳多樣性在本質上是DNA 一級序列的多樣性。近年來，隨著DNA 測序技術的迅速發展和日益普及，DNA 測序在遺傳多樣性的研究中正在起著越來越大的作用。本章將介紹目前在遺傳多樣性研究中常用的一種手動和一種全自動雙鏈DNA 測序方法。1.DNA 模板的制備在遺傳多樣性的研究中，由于樣本量一般都較
重復[DNA]序列的概念
中文名稱重復[DNA]序列英文名稱repetitive [DNA] sequence定 義DNA分子中重復出現的核苷酸序列。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
基因組所開發出編碼蛋白質DNA序列并行比對工具ParaAT
中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室“百人計劃”章張研究員，帶領其團隊成功開發出“編碼蛋白質DNA序列并行比對工具—ParaAT（Parallel Alignment and back-Translation）”。該研究成果發表在Biochemical and Biop
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源：monticelloshop.org 近日，法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味，廣受稱贊，這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日，相關論文在線刊登于《自然
DNA－前導序列的結構特點
前導序列是結構基因中編碼區之前的一段序列，這部分序列能被轉錄，但不被翻譯，在mRNA是從5′端起至結構基因第一編碼子開始點（通常 AUG）為止，在蛋白質合成過程中不被翻譯。
細胞化學基礎端粒DNA序列
端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是與端粒酶結合，完成染色體末端復制。端粒酶以其自身的RNA 為模板，在染色體端部添加上端粒的重復序列。作為模板的RNA 比較短，含有1.5 個端粒重復單元。端粒結構還能防止染色體融合及降解。端粒是保護DNA分子中的基因的
DNA－下游序列的結構特點
中文名稱下游序列英文名稱downstream sequence定 義DNA或RNA分子中，相對于某一序列的3′方向的序列。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），總論（二級學科）
首個CRISPR/Cas9靶序列數據庫
近期，來自美國國立衛生研究院和瑞典烏普薩拉大學的研究人員，在國際著名學術期刊《Nucleic Acids Research》上發表的一項研究中，首次提出了一個已在斑馬魚中經過實驗驗證的CRISPR/Cas9靶序列數據庫。 CRISPR及CRISPR相關蛋白（Cas9），是在古細菌和細菌中發現的
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月，在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序，它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先，這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列；其次，這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前，人們通過傳統的遺傳學方法已確定
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中，有超過100種已經進行了基因組測序，但是，只有9種爬行動物（在10000個物種當中）的基因組對科學界來說是可用的。最近，瑞士日內瓦大學（UNIGE）的一個研究小組，構建了一個大的數據庫，其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序，這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
基因組的三維結構
摘要： 闡明染色質復雜結構的技術有染色質構象捕獲(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技術4C、5C，這些提供了長距離的染色質相互作用，但不能擴展到整個染色質相互反應組。在2009年末，兩種新方法的迸發，有望繪出全基因組范圍的相互作用圖譜。
DNA保守序列的結構特點
保守序列（Conserved Sequence）：指在進化過程中基本保持不變的?DNA?分子中的一個核苷酸片段或者蛋白質中的氨基酸片段。