利用貝葉斯方法推斷中生代鳥類分化時間和特征演化速率
近日，《英國皇家學會開放科學》（Royal Society Open Science）在線發表了中國科學院古脊椎動物與古人類研究所張馳和王敏的研究工作。該研究利用貝葉斯末端定年法（Bayesian tip dating）推斷了中生代主要鳥類支系的系統發育關系、分化時間及特征的演化速率，并包含這些參數的不確定性，為討論原始鳥類身體不同部位的形態特征演化提供了新的信息。 在原始鳥類演化為現生鳥類的歷史上，中生代的幾大基干類群經歷了恐龍向鳥類演化以及鳥類演化初期一些重要特征的變化，而且身體不同的骨骼部位的變化程度也有顯著差別。傳統的分析往往采用定性的描述或者通過多步計算來推演出特征演化速率的變化（如王敏和Graeme Lloyd 2016年的研究），而這種多步計算會在中間過程損失很多信息，并且沒有考慮其中的不確定性。貝葉斯末端定年法能夠綜合利用化石形態和年代的信息進行整合的分析，不需要分步推斷各個參數，并在計算中包含了樹拓撲結構......閱讀全文
利用貝葉斯方法推斷中生代鳥類分化時間和特征演化速率
近日，《英國皇家學會開放科學》（Royal Society Open Science）在線發表了中國科學院古脊椎動物與古人類研究所張馳和王敏的研究工作。該研究利用貝葉斯末端定年法（Bayesian tip dating）推斷了中生代主要鳥類支系的系統發育關系、分化時間及特征的演化速率，并包含這些
古脊椎所等揭示中生代鳥類頭骨演化特征
近日，eLife發表了中國科學院古脊椎動物與古人類研究所王敏、托馬斯、周忠和與合作者關于早期鳥類頭骨演化的論文（Insight into the evolutionary assemblage of cranial kinesis from a Cretaceous bird）。該研究通過高精度
宏演化分析揭示翼龍的興亡史
2023年2月13日出版的《當代生物學》（Current Biology）在線發表了中科院古脊椎所余逸倫，張馳研究員，徐星研究員關于翼龍多樣性大尺度演化的成果。該研究詳細的討論了翼龍從起源至滅絕多樣性的變化過程以及潛在的影響因素。研究結果顯示，翼龍的演化歷史大致可以分為兩個階段，即長達115個百萬年
古脊椎所等揭示原始鳥類演化速率的不均一性
近年來，隨著大量特征矩陣和譜系關系的獲得，對生物大類群在長時間尺度上的演化模式進行量化分析成為了重要的研究方向。鳥類的起源與早期演化一直以來都是脊椎動物演化研究的重點。然而，原始鳥類各支系的演化模式，如形態特征的變化快慢、不同類群的演化模式異同等，由于長期缺乏量化分析，仍不清楚。 4月5日，最
科學家首次證實古鳥類葉食性的早期起源和演化
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505787.shtm近日，由中國科學院古脊椎動物與古人類研究所主導的熱河生物群中古鳥類食性研究取得新進展，研究人員從1.2億年前遼西熱河生物群古鳥化石胃容物中發現了被子植物早期分支木蘭類葉子的植硅體，首次
分子物種定界可使用貝葉斯模型選擇方法和參數估計方法
物種定界是分類學最基本的問題，基于貝葉斯模型選擇方法的BPP軟件是最為廣泛使用的分子物種定界軟件。一些對貝葉斯物種定界的模擬研究認為BPP軟件檢測到的是群體分化而非物種分化，并且當分析多基因數據時，該軟件傾向于過度定界，即過度劃分物種。 近日，中國科學院數學與系統科學研究院科研人員在分子物種定
npj:－層狀材料設計—主動學習與貝葉斯優化
由過渡金屬二硫屬化合物單層垂直堆疊而成的異質結在光電和熱電器件領域擁有巨大的應用潛力。發現用于特定領域的最優層狀材料，需要先估算關鍵的材料特性，例如電子能帶結構和熱輸運系數。然而，通過嚴格從頭算方法搜索整個材料結構空間來篩選材料特性大大超過了目前計算資源的限制。此外，材料特性函數對其結構的依賴性
多學科整合方法揭示鳥類重要特征演化機制
2月6日，國家基因庫生物多樣性基因組學團隊、日本東北大學、東京大學等單位的科學家們共同揭開鳥類特有性狀的形成及宏觀演化之謎——特異性保守序列對鳥類特有性狀的宏觀演化起到重要作用。此項關于鳥類基因組特異性保守序列（avian-specific highly conserved elements,
研究發現中生代鳥類生殖和個體發育
近期，《國家科學評論》（National Science Review）發表了中國科學院古脊椎動物與古人類研究所王敏、鄒晶梅、Alida Bailleu、李志恒的關于早期鳥類生殖和個體發育方面最新研究成果，報道了迄今發現的髓質骨保存最完好的中生代鳥類化石，證明了髓質骨在骨骼系統中廣泛分布這一模式
從恐龍到鳥，為何演化變慢？
生命演化史上有一些重要的節點事件，比如頜的出現，魚類登上陸地，爬行動物飛上藍天等等。過去，科學家理所當然地認為，當這類具有“演化革新”意味的特征或者形態功能在某一類群中剛剛出現時，該類群的演化速率會變快，多樣性也會增加。原因是，這些“革新”能夠幫助生物快速進入新的生態位。中國科學院古脊椎動物與古人類
古脊椎所等發現最早的恐龍蛋為革質蛋
恐龍生殖生物學特征的宏演化是備受關注但爭議不斷的領域。過去幾十年來，一些保存狀態良好的蛋窩與成體關聯標本提高了古生物學家對這一領域的認知。然而，由于化石證據稀缺以及缺乏大尺度的定量分析，關于生殖特征宏演化模式的研究有限，尤其是白堊紀之前的演化歷史。本研究報道了一種發現于貴州省的早侏羅世蜥腳形類恐
我國首次發現體內保存蛋殼的中生代鳥類化石
鳥類演化的成功與其獨有的生殖孵育系統密不可分。3月21日，周忠和、鄒晶梅、巴約勒團隊在英國《自然-通訊》（Nature Communications）雜志在線報道了世界范圍內首個腹腔內含有蛋殼的滅絕鳥類——反鳥類化石，為研究古鳥類的生殖繁育提供了新的信息，進而為探知早期鳥類的演化歷程提供了新的證
英國科學家利用貝葉斯原理詮釋細胞信號網絡
繁復的細胞信號網絡的解析一直是困擾生物學界的一個難題，眾多的傳導路徑往往使研究人員無從入手，給具體實驗研究帶來極大困擾。而英國格拉斯哥大學研究人員最近證實，通過貝葉斯統計模型，不僅能對細胞信號通路模型進行評級，遴選出最優的傳導路徑，還可對細胞信號網絡模型進行全新的詮釋。這一代表了細胞
古脊椎所發現體內保存蛋殼的中生代鳥類化石
鳥類演化的成功與其獨有的生殖孵育系統密不可分。3月21日，中國科學院古脊椎動物與古人類研究所周忠和、鄒晶梅、巴約勒團隊在英國《自然-通訊》（Nature Communications）雜志在線報道了世界范圍內首個腹腔內含有蛋殼的滅絕鳥類——反鳥類化石，為研究古鳥類的生殖繁育提供了新的信息，進而為
換牙還分奇偶數－這種中生代鳥類的牙齒間隔替換
對于包括人類在內的多數哺乳動物來說，一生中通常會生長和發育出乳齒與恒齒兩套牙齒，這被稱為雙齒性。而與之不同的是，在大多數兩棲類、爬行類動物中，普遍存在多次替換牙齒的現象。 在多姿多彩的自然界中，鳥類是種類最為繁盛的脊椎動物之一。身披羽毛、前肢為翼、骨骼中空而輕盈，它們憑借一身特殊的“裝備”自由
我國中生代鳥類化石中首次發現肺部結構
2018年10月22日，《美國科學院院刊》（PNAS）發表了中國科院古脊椎動物與古人類研究所鄒晶梅、周忠和等，臨沂大學王孝理、鄭曉廷等，約翰內斯堡大學John N. Maina，南京地質與古生物研究所泮燕紅等組成的國際研究團隊最新的研究成果，報道了在一件距今1.2億年前的原始鳥類上保存的肺部結
國際學者聚焦“中生代哺乳動物演化新證據”
2018年6月6日~8日，由北京自然博物館、中國科學院古脊椎動物與古人類研究所主辦，北京自然博物館承辦，北京市科學技術研究院、國家古生物化石專家委員會辦公室、中國自然科學博物館協會自然歷史專業委員會支持的“中生代哺乳動物國際研討會”在北京舉行。 人類一直在探索自己究竟是從何而來的，而哺乳動
中國發現古老鳥類化石長有鋒利牙齒
中國遼寧發現了一種長有古怪牙齒的鳥類的骨架化石 一具擁有奇特尖牙的鳥類化石在中國發現，這些特化的牙齒能夠咬開堅硬的食物 北京時間1月10日消息，古生物學家近日在中國遼寧發現了一種長有古怪牙齒的鳥類的骨架化石，距今已有1.25億年歷史。化石保存的狀況極好，能清楚看到殘留的胃容物。研究
我國科學家探索鳥類頭骨演化奧秘
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/490863.shtm本報北京12月8日電（記者齊芳）現生鳥類雖然沒有“手”，但具有極其靈敏的喙，能夠取代“手”完成大量精細的動作。研究認為，這是由于現生鳥類具有頭骨可動性——其頭部的部分骨骼能夠發生相互
化石為鳥類羽毛分子演化提供直接證據
1月28日，由中國科學院南京地質古生物研究所副研究員泮燕紅等完成的題為《羽毛分子演化的化石直接證據》的研究成果，在線刊登在《美國科學院院報》（PNAS）上，為探討早期羽毛的演化提供了分子生物學證據。中科院古脊椎動物與古人類研究所周忠和院士、臨沂大學鄭曉廷教授、美國北卡羅來納州立大學Mary S
古鳥類葉食性的起源有了新證據
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505801.shtm被子植物決定了現代地球陸地生態系統主要景觀構成，維持著包括人類在內大量多門類生物類群的生存需求。長久以來，科學家認為鳥類可能在被子植物起源和早期多樣性方面扮演著協同演化的重要角色。然而
周忠和任中科院古脊椎所所長
據中國科學院古脊椎動物與古人類研究所網站消息：8月23日，中科院古脊椎所完成所長換屆，擔任古脊椎所所長。 周忠和，出生于江蘇省江都市。1986年獲南京大學理學學士學位。1989年獲中科院研究生院碩士學位。1999年獲美國堪薩斯大學博士學位。現為中國科學院古脊椎動物與古人類研究
“中華龍鳥”標本合璧講述鳥類起源演化故事
近日，以“鳥類的恐龍起源學說”為主題的《恐龍與鳥》專題展在中國地質博物館開幕。來自于中國科學院南京地質古生物研究所（以下簡稱南京古生物所）的“中華龍鳥”標本（模型）與保存在中國地質博物館的“中華龍鳥”對開標本合璧參展，共同講述鳥類起源演化的故事。“中華龍鳥”標本由我國古生物學家于1996年8月在遼寧
數學院等在貝葉斯模型選擇漸進行為研究中取得進展
近日，中國科學院數學與系統科學研究院和英國倫敦大學科研人員合作的關于貝葉斯模型選擇的漸進行為的研究成果，在線發表在PNAS上。研究表明，貝葉斯模型選擇的病態漸進行為是使用貝葉斯方法進行物種進化樹估計得到不合理結果的可能原因。 模型選擇與假設檢驗是統計學中比較棘手的問題。經典統計與貝葉斯統計的處
研究揭示貝葉斯全證據定年對物種采樣偏差具有穩健性
隨著基因組數據的涌現以及形態學數據的積累，綜合利用分子序列和形態性狀進行整合的數據分析逐漸成為演化生物學尤其是系統學研究的熱點。與單獨依賴化石信息或分子數據相比，整合多方面的數據能夠得到更可靠的統計推斷結果，對探討諸多演化生物學問題具有基礎重要性。由于模型的復雜性，合理運用整合分析并在模型和方法
中科院院士組Nature子刊文章
來自中科院古脊椎動物與古人類研究所，臨沂大學等處的研究人員根據東北地區發現的新鳥類樣品，獲得了鳥類胸骨進化的新發現，指出反鳥亞綱鳥類胸骨形成方式上的不同，這強調了鳥類研究中對同源性和古生物骨骼特征進化理解的重要性。相關成果公布在Nature Communications雜志上。 這項研
螽斯化石解讀2億年前的“交響樂”
中科院南京地質古生物研究所（以下簡稱南京古生物所）的研究人員揭示了中生代螽斯聲學行為的演化，為昆蟲和早期哺乳動物的聲學共演化假說提供了證據，也為動物的聲學演化機制和中生代的聲學景觀提供了新信息。相關研究成果12月13日在線發表于美國《國家科學院院刊》。 動物在求偶、交配、捕食和躲避天敵等行為中
探索原始生命奧妙，揭秘熱河生物群隱藏的生命演化密碼
周忠和，中國科學院院士，進化生物學及古鳥類學家，曾任中國科學院古脊椎動物與古人類研究所所長，長期從事中生代鳥類與熱河生物群的研究，提出了熱河生物群是若干生物進化搖籃的假說，找到了一系列支持鳥類恐龍起源學說和鳥類飛行樹棲起源假說的新證據，發現并命名了若干中生代鳥類化石，通過深入研究早期鳥類的系統演
螽斯化石解讀2億年前的“交響樂”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/491048.shtm ? 侏羅紀螽斯的生態復原圖。楊定華/繪 本報訊（記者沈春蕾）中科院南京地質古生物研究所（以下簡稱南京古生物所）的研究人員揭示了中生代螽斯聲學行為的演化，為昆蟲和早
科學家在我國中生代鳥類化石中發現髓質骨
12月5日，英國《自然-通訊》（Nature Communications）在線刊發了中國科學院古脊椎動物與古人類研究所鄒晶梅、周忠和團隊與國外同行（包括美國自然歷史博物館教授Mark Norell 以及佛羅里達州立大學教授Gregory Erickson）合作的最新研究成果，首次報道了早白堊世